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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000978`

染色体: Chr03 坐标: 11064062-11066677 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000978`
名称	SmilChr03G000978
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	11064062 - 11066677 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017552`
GeneID	`131017552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017552`
原始查询	`LOC131017552`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
产物	putative disease resistance RPP13-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.4; qcov=0.968; evalue=8.02e-27; confidence=low
Rice	`Os10g0136100` - identity=28.4; qcov=0.91; evalue=6.18e-33; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802331.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802331.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802331.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802331.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802331.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:11064644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:11064679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:11064688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B133,B78
`Chr3:11064780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B18,B2,B85,C37
`Chr3:11065394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A19,A3,B100,B102,B103,B11,B119,B12,B120,B126,B129,B132,B138,B21,B25,B32,B33,B45,B55,B62,B68,B72,C19,C25,C3,C35,C40,C49,C55,C57,C7,C72,C83,C87,D11,D2,D4,D7,D8
`Chr3:11065404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr3:11065411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B9
`Chr3:11065423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B9
`Chr3:11065459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:11065467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr3:11065476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr3:11065495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B26,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802331.1

468 aa

234

468

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 5-113 aa PF23598 LRR_14 326-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802331.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	5	113	6.3e-11	42.9	NB-ARC domain
`XP_057802331.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	326	436	6e-18	65.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946348.1
CATGTCGGAGGCCCTCCTCTTATCACTGATACAGAAGCTCGACACTAATTATCGAAGGCATGAACCAAATGACGAAAAGGTAATTAAAGAGATGCGAGAGATTGTGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGAGGGAAGAACCCTAAATTTTTTTGTATGTGACCTTGTCGACGTGGCTGACGATGCTCTCTTCCTTTTCAAACAAGACGCAACCTATCCTTGGAAATTTGATTCCGTGCATAGTTGGATGGGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017552
ATGAAAGAGCTACTCATCAAACTCGTACAACAAGTAGTTCAAGAGAATCTCCATATATCTTCCTTATTGGAGAATATGGACAACCGAAGCCTCCGAGATATGCTTCGCCAACACCTGCAAGGAAAGAGATATCTTATAGTTCTCGACCACATGCCCAAACAAATGCCCTTGAGGTCTTTAGGGGAAGCTCTTCCAGCAGGATACAAGGAAAGTACATTGCTGCTCACAAGTCACACGACACATCCCGACTTAGGTGTACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802331.1
MKELLIKLVQQVVQENLHISSLLENMDNRSLRDMLRQHLQGKRYLIVLDHMPKQMPLRSLGEALPAGYKESTLLLTSHTTHPDLGVRDEDVHKMKPLNSKQSWQLFLKTINHGNTLTGEHKFPMSLKHMAEQMLRKCGGLPLGIKEVGKQLAEKKVSGGSEWEQLLESVDFDSTLKLLEPFYHKLDLKLDSCFLSMAFFKENITLRKEKLIQIWVAGGVVVQASEYDCGLYLDGLVNESFIEVGDKSTEYHLNALLHMLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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