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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001200`

染色体: Chr03 坐标: 13838848-13840439 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001200`
名称	SmilChr03G001200
描述	uncharacterized SmilChr03G001200
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13838848 - 13840439 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017572`
GeneID	`131017572`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017572`
原始查询	`LOC131017572`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017572

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802359.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802359.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802359.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802359.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13839028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B8
`Chr3:13839052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B58,C60
`Chr3:13839068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,C49,C62,C75,D2
`Chr3:13839078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C68
`Chr3:13839255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr3:13839417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C27,C36,C37
`Chr3:13839417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C27,C36,C37
`Chr3:13839432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B97,C82
`Chr3:13839457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B83,C33
`Chr3:13839479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B103,B44,B51,B87,C55,C6,C66
`Chr3:13839505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B18,B32,C86,D8
`Chr3:13839515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B1,B7,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802359.1

370 aa

185

370

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 174-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802359.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	174	300	1.1e-11	45.8	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946376.1
GTACCATGTCTCATCGTAGAGGATTGTTGGGGTTTGGTAGTCGGTCTTCTGGGCCTGAGGCACAGTCCTCCTCAGGCTCTGGGCCGTATATTTCCGCTACTCCAGAGTCTGGTTCCTCTCCACAGAGCGCTGCTGCATCTGGGTCTAGAAGGCCCAAAGGCAAATCAGTGGCGCAGATTAGGGCTGAGTGTGTTAGGCGCGACGGGAGGATCCTCTTTCAGAGGAATACTGTTGGTAAGTTGATCGAGCCCCCGGGGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017572
ATGTCTCATCGTAGAGGATTGTTGGGGTTTGGTAGTCGGTCTTCTGGGCCTGAGGCACAGTCCTCCTCAGGCTCTGGGCCGTATATTTCCGCTACTCCAGAGTCTGGTTCCTCTCCACAGAGCGCTGCTGCATCTGGGTCTAGAAGGCCCAAAGGCAAATCAGTGGCGCAGATTAGGGCTGAGTGTGTTAGGCGCGACGGGAGGATCCTCTTTCAGAGGAATACTGTTGGTAAGTTGATCGAGCCCCCGGGGATCTCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802359.1
MSHRRGLLGFGSRSSGPEAQSSSGSGPYISATPESGSSPQSAAASGSRRPKGKSVAQIRAECVRRDGRILFQRNTVGKLIEPPGISTCCTNSFKRIPNPGGYTWKLTPPTVQELYFEEFKKEFTWNPEDEADVKKMWLEKARKRYSDNMSEYKRLLKQKTEAGEMMETPLGMSDTFWTGLKAYWDQDEVKAVSRRARENRYSEPDGVGTGISRHVGGSQSSRILQQSLLVDGEVPPTASNYSTFLRLHMYADGTFVSEKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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