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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001064`

染色体: Chr03 坐标: 12356058-12357908 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001064`
名称	SmilChr03G001064
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12356058 - 12357908 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017573`
GeneID	`131017573`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017573`
原始查询	`LOC131017573`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
产物	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
Arabidopsis	`AT1G56670` (AT1G56670) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842122] identity=42.7; qcov=1; evalue=1.29e-103; confidence=medium
Rice	`Os01g0329900` (OsGELP14) - identity=42.7; qcov=0.905; evalue=1.58e-88; confidence=medium
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017573

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057802360.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057802360.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802360.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802360.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802360.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12356171`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	50	A13,A18,A2,A4,A5,A8,B10,B101,B103,B117,B12,B124,B127,B13,B131,B14,B21,B29,B32,B42,B43,B5,B52,B55,B57,B62,B66,B68,B71,B73,B75,B78,B99,C10,C13,C21,C32,C43,C45,C49,C65,C73,C76,C80,C82,C84,C86,D1,D2,D3
`Chr3:12356179`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B23,B59,D9
`Chr3:12356179`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B23,B59,D9
`Chr3:12356309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:12356442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr3:12356447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr3:12356482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B65
`Chr3:12356542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A13
`Chr3:12356542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr3:12356576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C18
`Chr3:12356582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C74
`Chr3:12356596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802360.1

370 aa

185

370

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 61-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802360.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	61	353	5.6e-41	141.7	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946377.1
TCTTTTCAGTTTTCCCATTTTCCATTTTGTGATTCTAATGGGTAATATTGATATGAAACTCTCCATGCATTCAATCTTGATGGAGACAATCAGATCCTCTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCCCCATACAACCTTCTTTCCCATCTCTCTGTCTTCACCAAACTTTCTTAACCCAAAGTTGCAATAAGAGTTTGGTGACCGGATTTAATGATAGTAAATGAATTAACCAAATAAAGTTAATTTGCATGCATCAGCTCTTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017573
ATGCGAGTAATGCTTTTAAGCCATCGCATTCTCTCCTTCTGCATCTTCCTATCCTTTCCAGCTAAAAAAAACAAGAAAATGTATTATTCCAGCAAAATCTCCCTTGCTCTCGTGTGCTTCTTCTTCCTTGGCTTCGGCACTACCGCGGCGACGGCGGCCGCCTGCAGCAAAGAACCAGTTTTATTCAACTTCGGAGATTCCAACAGCGACACAGGCGGCGCTTCTGTTCTTGGAGGGAAGCCGCTCGAGTTCCCGGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802360.1
MRVMLLSHRILSFCIFLSFPAKKNKKMYYSSKISLALVCFFFLGFGTTAATAAACSKEPVLFNFGDSNSDTGGASVLGGKPLEFPEGRTFFHEPTGRVSDGRLILDFLCESLETKFLTPYLELFTPDFSNGVNFALAGADSRLGISIPPNAFTLGNQFAEFSRFQNVSIRRGSLDAGQVKSALFMLDIGQNDLQFDSNTLTPQQVLERVPIVASNIRDTMQKLYQLGGRNFWVHNTGPLGCLPNNVARINASTVVDEYGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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