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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000944`

染色体: Chr03 坐标: 10709385-10713375 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000944`
名称	SmilChr03G000944
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10709385 - 10713375 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017584`
GeneID	`131017584`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017584`
原始查询	`LOC131017584`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=30.2; qcov=0.943; evalue=6.65e-34; confidence=low
Rice	`Os10g0136100` - identity=30.7; qcov=0.829; evalue=1.12e-33; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017584

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057802369.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802371.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802371.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802369.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802369.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10711488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A8
`Chr3:10711488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr3:10711533`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr3:10711533`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D4
`Chr3:10711629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B4,B64,C8,C85
`Chr3:10711683`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A15,B108,B109,B110,B56,B96,C36,C62,C81
`Chr3:10711754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,B97
`Chr3:10711760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B53
`Chr3:10711806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B53
`Chr3:10711824`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B3
`Chr3:10711824`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B3
`Chr3:10711831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802369.1

335 aa

168

335

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 24-183 aa

XP_057802370.1

335 aa

168

335

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 24-183 aa

XP_057802371.1

334 aa

167

334

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 24-182 aa

XP_057802373.1

334 aa

167

334

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 24-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802369.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	24	183	1.1e-28	100.7	NB-ARC domain
`XP_057802370.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	24	183	1.1e-28	100.7	NB-ARC domain
`XP_057802371.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	24	182	9e-30	104.2	NB-ARC domain
`XP_057802373.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	24	182	9e-30	104.2	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946390.1
AAAATTTTATGCGTGAAACAATAAGTCAACACTTCAGCTGGCTCGATTTAAGCTCGTGATGTTATTATTTTATTAGTGGTTGTTAAATATGCACATTATTTGGCTTCTTCAACTGGAAAATTCAAAATCCCTAATTCTACTCAAACGAAATTCAAAATTCACATTAAACACCGCCGGATTCTGCAGCGCCGCACATTAGTTGATCCGTCACCGGCAGCCCAGTTAATTTGTTCCAAGCAGAAGTATGTCGGAGGCGCTCC...

XM_057946386.1
TTATGCGTGAAACAATAAGTCAACACTTCAGCTGGCTCGATTTAAGCTCGTGATGTTATTATTTTATTAGTGGTTGTTAAATATGCACATTATTTGGCTTCTTCAACTGGAAAATTCAAAATCCCTAATTCTACTCAAACGAAATTCAAAATTCACATTAAACACCGCCGGATTCTGCAGCGCCGCACATTAGTTGATCCGTCACCGGCAGCCCAGTTAATTTGTTCCAAGCAGAAGTATGTCGGAGGCGCTCCTCTTAT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131017584
ATGTGGTGGGCTTGGGGGAAGATGTGGAAATGCTTGCTTCGCACAAAGATTATTGGTGGGAAAGGATACAACAGTTGGATTGTTCTTATCAAAGGGATGAGTGGTATTGGAAAGACAGCTCTTGCGAGAAAGATATACAACCATCCAACCATCATTCAGCACTTCGAGCCTCGTGCTTGGGTATCTAATTCTGCTCACTTCACTATTAAAGAGCTACTTATCAAACTAATACAACAGGTAGAAGATCCTCAGAATCTCCA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057802369.1
MWWAWGKMWKCLLRTKIIGGKGYNSWIVLIKGMSGIGKTALARKIYNHPTIIQHFEPRAWVSNSAHFTIKELLIKLIQQVEDPQNLHSSSLLENMDNESLRDMLYQHLKGTRYFVVLDDVPKQMHLKSFLQILPEGSGNGSRLLLTSHMMHVDIYVRDENVHQMKPLDAEKSWQLFLKTINHGNRLTGEHKFPKSLEHMGKQMLRKCDGLPLAIKEVGKQLAEKKVSEGIEWEQLLESVDFGSMLKLLEPFYLQLDPKLE...

XP_057802370.1
MWWAWGKMWKCLLRTKIIGGKGYNSWIVLIKGMSGIGKTALARKIYNHPTIIQHFEPRAWVSNSAHFTIKELLIKLIQQVEDPQNLHSSSLLENMDNESLRDMLYQHLKGTRYFVVLDDVPKQMHLKSFLQILPEGSGNGSRLLLTSHMMHVDIYVRDENVHQMKPLDAEKSWQLFLKTINHGNRLTGEHKFPKSLEHMGKQMLRKCDGLPLAIKEVGKQLAEKKVSEGIEWEQLLESVDFGSMLKLLEPFYLQLDPKLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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