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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000928`

染色体: Chr03 坐标: 10612371-10613598 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000928`
名称	SmilChr03G000928
描述	uncharacterized SmilChr03G000928
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	10612371 - 10613598 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017589`
GeneID	`131017589`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017589`
原始查询	`LOC131017589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=35.8; qcov=0.548; evalue=1.36e-26; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017589

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057802378.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802378.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057802378.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057802378.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057802378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:10612607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B129,B134,C70,C87
`Chr3:10612627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,C74
`Chr3:10612638`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C43
`Chr3:10612638`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C43
`Chr3:10612649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B132,C58
`Chr3:10612663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr3:10612674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B28,B56,C27,C67
`Chr3:10612675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr3:10612761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B29,B35,C49
`Chr3:10612761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B35,C49
`Chr3:10612762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B111,C46
`Chr3:10612767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B64,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802378.1

321 aa

160

321

PEG10_N-capsid

Ty3_capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 76-155 aa PF19259 Ty3_capsid 76-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802378.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	76	155	1.2e-14	55.1	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057802378.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	76	234	4.5e-09	36.7	Ty3 transposon capsid-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946395.1
ATGCAAGTTATTATGAGAAAGTTCAGTATACAAGTTATTATGTTGAAGATTATTGCAGCTATGAATTTTATTTCGGAATTTTACAGTTCATGACATTGAGATTTGATGAGTTCAAACTTTTCATGTTGAATATAGTCCTCGAATTAGGAATAACCTAGCATTTTCCTAGAAAAGTCTTGTTTTATAATCCCTTATTTATGTGATAGTGCCTCTGAATATAGAACCATGAGGAATACGCGTGCACATTCCCACCACGCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017589
ATGAGGAATACGCGTGCACATTCCCACCACGCCGAGAACTCAAATACAAATTCCGAAGCAGAAGCTGGACAACCTCATCCAACTAATGGAGGAGACTTCATGAGTCAATTTCTGAGCGCCTTACAAGGTTTTGTCCAACAGCAAACCCAAACTCAGGCTACGCAGCGAGACCTAAACCAGACCTCTAACACAATGGATCAAGCGGTAGAGCGATTTCGGAATTATAATCCGCCACGATTCAATGGACGTGATGGACCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802378.1
MRNTRAHSHHAENSNTNSEAEAGQPHPTNGGDFMSQFLSALQGFVQQQTQTQATQRDLNQTSNTMDQAVERFRNYNPPRFNGRDGPLAAEEWLEELERIFTHINCTEEQKVSCAVFQLKEDARQWWKHFYRLLGEEDRNVLNWKIFKGVVMDKYFPLSFREKKETEFFELKQGNMTIEEYERKFNELARFAPHLVDTEDKMIARFRKGLRTDIKGIMAAHVIEDFSDLVKRAEEVATALGSNIPAQKPANQPMKRKWENY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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