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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001374`

染色体: Chr01 坐标: 27061300-27064121 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001374`
名称	SmilChr01G001374
描述	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 12-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27061300 - 27064121 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017591`
GeneID	`131017591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017591`
原始查询	`LOC131017591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 12-like
产物	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 12-like
Arabidopsis	`AT3G43720` (LTPG2) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823481] identity=47.4; qcov=0.627; evalue=1.44e-23; confidence=medium
Rice	`Os05g0489200` (OsLTPG12) - identity=57.1; qcov=0.53; evalue=4.6e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802382.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057802382.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802382.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802382.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802382.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27063758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C21
`Chr1:27063761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,D4
`Chr1:27063772`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr1:27063772`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B36
`Chr1:27063799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B72,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802382.1

185 aa

185

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 34-127 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 49-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802382.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	34	127	3.2e-18	66.4	Probable lipid transfer
`XP_057802382.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	49	123	2.9e-12	47.4	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946399.1
TAGAAATTTGAAATGTGAAAGAAATTAGAAGCACGAGTTTGGCGGTTGGGCCCATTCGAATTTCTTCCTTACACACATAATTTCCTGAATCGCTAGCTGTTTCCCCCTAATAAATAATCCGCATTTCATTAATTTCCCCTCATATTTATAACCATAGTTAGAGTTGAATACTGAAACGAAGCAACCTCAACACACATCCAATCTCTATAACCACACCACAGCCATAGCCATGTTCTCCACCACCACCATTGCCTACCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017591
ATGTTCTCCACCACCACCATTGCCTACCCACTGATGCTCGCAATCGTGATGGCGGCGGCGGCAACCGCGCAATCACCTGCGCCGGCGCCGGCGGTGGAGGCGCCGGGGCCGTTTTACCCCGTTGCACCTGCGCCGGCGCTGGATTGCTTCACATATCTATTAAACCTTTCGGATTGCCTGACATTTGTGCAGGAGGGCAGTAATCTGACCGAACCGGACAAGGGTTGCTGCCCGGAGCTGGGCAATTTGGTCGATACGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802382.1
MFSTTTIAYPLMLAIVMAAAATAQSPAPAPAVEAPGPFYPVAPAPALDCFTYLLNLSDCLTFVQEGSNLTEPDKGCCPELGNLVDTQPICLCQLLGDPSQVGISVDVDRALKLPSLCNVTTPPVSLCAAIGIPVSALAPSEAPSPGGGETASPPSPGGDDGSATSLVSKHHFLIGLASLFFIYFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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