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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001034`

染色体: Chr03 坐标: 12040241-12045641 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001034`
名称	SmilChr03G001034
描述	plasmodesmata-located protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12040241 - 12045641 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017592`
GeneID	`131017592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017592`
原始查询	`LOC131017592`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plasmodesmata-located protein 2-like
产物	plasmodesmata-located protein 2-like
Arabidopsis	`AT3G04370` (PDLP4) plasmodesmata-located protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819592] identity=36.1; qcov=1.03; evalue=5.17e-44; confidence=medium
Rice	`Os03g0140500` - identity=33.8; qcov=0.864; evalue=5.27e-30; confidence=low
GO	GO:0009506 (plasmodesma); GO:0010497 (plasmodesmata-mediated intercellular transport); GO:0046739 (transport of virus in multicellular host)
KEGG	-
Pfam	PF01657 (Stress-antifung)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802380.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802380.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802380.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802380.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802380.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12041040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,A7,C37
`Chr3:12041061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr3:12042122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:12042165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,C55,C68,C87,D8
`Chr3:12042355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C13
`Chr3:12044945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B74,C40,C79
`Chr3:12044968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:12045011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B60,C52,C74
`Chr3:12045021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr3:12045076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:12045149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C14
`Chr3:12045314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802380.1

308 aa

154

308

Stress-antifung

PF01657 Stress-antifung 61-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802380.1`	Pfam	`PF01657`	Stress-antifung	Family	61	146	1.2e-17	65.1	Salt stress response/antifungal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099658.1
ATTCAAGCATTTATATATTTATCTCAAGTAGCAATAGACTTAGATTATTAGATGAAGTTAGGCTGGAAAAACACGTCCATTTTAACCAACAAAAATTCCATCTTCATAAAAACTTTACCACATTTTTCCCAACAGAAAGTGACGACACAACATGGTTTAAACGACGAATCACAACTCAATCATGCAAAGCACCAATGATCAATCCCAATCACAATCCCAATTAATGTATCCATTATCCATGATTAATCCCACCATAATCC...

XM_057946397.1
TTCAAGCATTTATATATTTATCTCAAGTAGCAATAGACTTAGATTATTAGATGAAGTTAGGCTGGAAAAACACGTCCATTTTAACCAACAAAAATTCCATCTTCATAAAAACTTTACCACATTTTTCCCAACAGAAAGTGACGACACAACATGGTTTAAACGACGAATCACAACTCAATCATGCAAAGCACCAATGATCAATCCCAATCACAATCCCAATTAATGTATCCATTATCCATGATTAATCCCACCATAATCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017592
ATGCAAAGCACCAATGATCAATCCCAATCACAATCCCAATTAATGTATCCATTATCCATGATTAATCCCACCATAATCCAGTTCCTAATCCCATTTTTTCTCCTCATAATCACACATTCCGCCAAAGCCCTAATCACAGACCACCACAAATTAGTATACACACAATGCTCAAACCATACCTCACCAAATCCCTCTCACGTTTTGTTACTCCCAAATCTATTTCAAGAACTCATCACACACTCTTCCAAAGCCGCCTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802380.1
MQSTNDQSQSQSQLMYPLSMINPTIIQFLIPFFLLIITHSAKALITDHHKLVYTQCSNHTSPNPSHVLLLPNLFQELITHSSKAAFFKTIVGDEKTAISGSFQCRKDLSSDECRSCVIKSSDLSENLCGKILPARIQLRGCYIRYEGEEDGAEPETDAGPEQILHRACSKRKIKRDGFEEMKYAAFGVVESCVMSENGFCEMVYESIRVSAQCVGSLRSACDCGECVARAAEFACEDECRYSVAGEVYIDGCFLSYYYYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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