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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001104`

染色体: Chr03 坐标: 12721315-12723204 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001104`
名称	SmilChr03G001104
描述	uncharacterized SmilChr03G001104
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12721315 - 12723204 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017602`
GeneID	`131017602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017602`
原始查询	`LOC131017602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838435]; symbol=AT1G18540; hit=AT1G18540; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribosomal protein L6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838435]; symbol=AT1G18540; hit=AT1G18540; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G18540` (AT1G18540) Ribosomal protein L6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838435] identity=69.2; qcov=0.364; evalue=3.13e-14; confidence=low
Rice	`Os04g0473400` (OsRPL6) - identity=60.4; qcov=0.371; evalue=5.58e-14; confidence=low
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057802394.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802395.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057802395.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802394.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802394.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12721481`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B42,B43,D6
`Chr3:12721481`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B42,B43,D6
`Chr3:12721483`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B42,B43,D6
`Chr3:12721483`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B42,B43,D6
`Chr3:12721486`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B42,B43,D6
`Chr3:12721486`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B42,B43,D6
`Chr3:12721500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr3:12721504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B21,B22,B71,C62
`Chr3:12721898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C79
`Chr3:12721923`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A19,B111,B128,B131,B138,B14,B29,B45,B59,B76,B84,C12,C16,C17,C18,C38,C5,C59,C7,C75,C80,C84,D11
`Chr3:12721925`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A19,B111,B128,B131,B138,B14,B29,B45,B59,B76,B84,C12,C16,C17,C18,C38,C5,C59,C7,C75,C80,C84,D11
`Chr3:12722123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B33,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946412.1
AAAACACTTATTGTTTACGTTCAAATCCCTCCCCTCTTTTTCCGAAACCCTCCGATTGCTGTCTCCCATTCAGCCTGATTTCCCCTCCACCGTCGGCGACGCTTTCTCCGGCCGGCCTCCGCCTCAGCACCCTACGCTGCTTCCCTAAAGGCGGTCTGCTATGCTATCGTTCCGCCTCCCGCTGTCGGTCCGCCTCCTCCAGTCGGAAGTTGCTGCAACGCGCCGCCCTTACACGCCCTCCACATGTGATGTTTCAAAAA...

XM_057946409.1
ACGTTCAAATCCCTCCCCTCTTTTTCCGAAACCCTCCGATTGCTGTCTCCCATTCAGCCTGATTTCCCCTCCACCGTCGGCGACGCTTTCTCCGGCCGGCCTCCGCCTCAGCACCCTACGCTGCTTCCCTAAAGGCGGTCTGCTATGCTATCGTTCCGCCTCCCGCTGTCGGTCCGCCTCCTCCAGTCGGAAGTTGCTGCAACGCGCCGCCCTTACACGCCCTCCACATGTGATGTTTCAAAAAATTTCACCTCCGTTGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131017602
ATGCTATCGTTCCGCCTCCCGCTGTCGGTCCGCCTCCTCCAGTCGGAAGTTGCTGCAACGCGCCGCCCTTACACGCCCTCCACATGTGATGTTTCAAAAAATTTCACCTCCGTTGAAATGCTTCGTGGAATATTTGCTCTTCCAAGTTGCTTTTGGAGGAGAAGCCTCTCAAATTCTACCCTGTCGATGAAGTTAAGAAGCCGCTCTCCTTGTTGCTCAAGGCCAAGCCCACCAAGATCAGCGAGCATTACTCCCGGAAC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057802392.1
MLSFRLPLSVRLLQSEVAATRRPYTPSTCDVSKNFTSVEMLRGIFALPSCFWRRSLSNSTLSMKLRSRSPCCSRPSPPRSASITPGTVLIILSGRFKGKRVVLLKQISSGLLLVTAVFSISYASRISWAYVNSLPEVIVIHTRSILLSFSCSLNLSSFFRPSICNKYCYISSDLFSISSINSSS

XP_057802394.1
MLSFRLPLSVRLLQSEVAATRRPYTPSTCDVSKNFTSVEMLRGIFALPSCFWRRSLSNSTLSMKLRSRSPCCSRPSPPRSASITPGTVLIILSGRFKGKRVVLLKQISSGLLLVTVFSISYASRISWAYVNSLPEVIVIHTRSILLSFSCSLNLSSFFRPSICNKYCYISSDLFSISSINSSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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