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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001088`

染色体: Chr03 坐标: 12581081-12582292 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001088`
名称	SmilChr03G001088
描述	YTH domain-containing protein ECT1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	12581081 - 12582292 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017618`
GeneID	`131017618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017618`
原始查询	`LOC131017618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	YTH domain-containing protein ECT1-like
产物	YTH domain-containing protein ECT1-like
Arabidopsis	`AT1G48110` (ECT7) evolutionarily conserved C-terminal region 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841229] identity=54.7; qcov=0.941; evalue=8.83e-26; confidence=medium
Rice	`Os03g0317000` - identity=51.6; qcov=0.941; evalue=2.33e-24; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0061157 (mRNA destabilization)
KEGG	-
Pfam	PF04146 (YTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057802419.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802419.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057802419.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802419.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802419.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:12581177`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B132,B136,B14,B3,B38,B39,B47,B56,B96,C14,C41,C77,D7
`Chr3:12581255`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A9,C50,C71
`Chr3:12581255`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A9,C50,C71
`Chr3:12581271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr3:12581272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C78
`Chr3:12581314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B45
`Chr3:12581353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr3:12581366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr3:12581390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C78
`Chr3:12581390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802419.1

101 aa

101

YTH

PF04146 YTH 6-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802419.1`	Pfam	`PF04146`	YTH	Domain	6	87	1.7e-10	41.5	YT521-B-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099689.1
TGCATACAAAGATGCCCAGAGAATTGGCTGCCCCATCTTCCTCTTCTTTTCTGTCAGTATATAACCATTATTTTCTCACATTATAATTATGTTTTCATGGCTATTTCCCTTGTTAATGTGTTTGGCCAGTTGTGTGGTATGGCAGAAATGAGTGGCCAAGTGGATTTCCAAAGAGATATGGATTTAGATAGGAGTGGAAGCTTTCCTTTAAAGTGGCACATCATAAAGGATTTGTCACACTTAAATCCTTTTAGGGACAA...

XR_009099690.1
TGCATACAAAGATGCCCAGAGAATTGGCTGCCCCATCTTCCTCTTCTTTTCTGTCAGTATATAACCATTATTTTCTCACATTATAATTATGTTTTCATGGCTATTTCCCTTGTTAATGTGTTTGGCCAGTTGTGTGGTATGGCAGAAATGAGTGGCCAAGTGGATTTCCAAAGAGATATGGATTTAGATAGGAGTGGAAGCTTTCCTTTAAAGTGGCACATCATAAAGGATTTGTCACACTTAAATCCTTTTAGGGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017618
ATGGCTATTTCCCTTGTTAATGTGTTTGGCCAGTTGTGTGGTATGGCAGAAATGAGTGGCCAAGTGGATTTCCAAAGAGATATGGATTTAGATAGGAGTGGAAGCTTTCCTTTAAAGTGGCACATCATAAAGGATTTGTCACACTTAAATCCTTTTAGGGACAACATATTGCAGAACAATGAGAACATGCCAGTGATTGACAACAGAGACATACAAAGGATAAGCTTCGATAAAGGTCTGGGTTTGTTTAGCTTATTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802419.1
MAISLVNVFGQLCGMAEMSGQVDFQRDMDLDRSGSFPLKWHIIKDLSHLNPFRDNILQNNENMPVIDNRDIQRISFDKGLGLFSLFKGHTSKTSLLSPAHE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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