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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001377`

染色体: Chr01 坐标: 27133255-27134563 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001377`
名称	SmilChr01G001377
描述	NDR1/HIN1-like protein 13
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27133255 - 27134563 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017619`
GeneID	`131017619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017619`
原始查询	`LOC131017619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NDR1/HIN1-like protein 13
产物	NDR1/HIN1-like protein 13
Arabidopsis	`AT2G27080` (AT2G27080) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817250] identity=47.6; qcov=1; evalue=1.22e-87; confidence=high
Rice	`Os01g0812100` - identity=43.5; qcov=0.884; evalue=1.83e-49; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802420.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802420.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802420.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802420.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802420.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27133801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A9,B52,C4,C76
`Chr1:27133810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C46,C49,C7
`Chr1:27133946`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A6,B16,C39
`Chr1:27133946`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A6,B16,C39
`Chr1:27133947`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A6,B16,C39
`Chr1:27133947`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A6,B16,C39
`Chr1:27134012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C78,C8
`Chr1:27134017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B18,B26,B27,B4
`Chr1:27134079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:27134107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B57,B73,C36
`Chr1:27134114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B39,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802420.1

268 aa

134

268

LEA_2

PF03168 LEA_2 140-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802420.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	140	243	1.7e-11	45.2	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946437.1
AGTTTCAACATATGTTACATTTTATCTTTGATTTCCTAATTTTTTTTCTTAATTATTATCTTTGATTTCCTAATTTTTTTCTTAATTATCATTCATATTTTTACAAAATCTTCTCAATTAAGTGCAAATCAAGCGGAGATTGAGGGTTGAGACTTGAGAGAGAAGAGGAAGACGTTGAATCAGAGATGCGAAACAGCTGTTAAATTTACGCGGCGCCTATTTTCCTTTACAACACTACGCGTTTCATACAAACCACTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017619
ATGACTGATGCACGGGTTCATCCTGCGACCGCCGACGCGCTGTCGCCGCCGCTGTCTTCCTCATCAGCCAAGGACTCCGGCGAATATCCAGTGCCGCCAAATCCTCTTCCGGCGAAACCGGTGCCTCCGCCGGCCACCTACGTCGTCCAGATCCCCAGAGAACAGATCCTCCGGTATCCGCCGCCGGAGAACGCCAGGAAGTTCCAAGCTCTCACCCGCCGCGGAAAGAGCGGGAGGAGCCGCTGCTGCTGTTGCACTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802420.1
MTDARVHPATADALSPPLSSSSAKDSGEYPVPPNPLPAKPVPPPATYVVQIPREQILRYPPPENARKFQALTRRGKSGRSRCCCCTLSLLAFLVIAAAISAGVLYLVFRFKSPNYAVTSLAIKGMNLTSAAPISPEFDVTIRAENPNGKIGIYYLKGSAINVFYNDVKLSHGVLPAFYQPKKNVTVLRPALTGSGVMLGGAVKASLTNEQNQGNIPFVVRTKVPVKIKVGSVKTWKITVKAKCDVVVDALNDKAKIVSND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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