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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001219`

染色体: Chr03 坐标: 14007534-14010076 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001219`
名称	SmilChr03G001219
描述	uncharacterized SmilChr03G001219
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14007534 - 14010076 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017738`
GeneID	`131017738`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017738`
原始查询	`LOC131017738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0359000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os05g0359000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os05g0359000` - identity=28.2; qcov=0.373; evalue=3.63e-06; confidence=low
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017738

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802439.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802439.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802439.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802439.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802439.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14008041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C11,C51,C69
`Chr3:14008041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C51,C69
`Chr3:14008062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A16,A18,B10,B102,B111,B126,B128,B17,B23,B24,B33,B48,B51,B54,B57,B60,B61,B69,B84,B86,B90,C14,C15,C16,C17,C27,C29,C31,C36,C45,C5,C70,C71,D4
`Chr3:14008183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B140
`Chr3:14008183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:14008201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,C25,C34,C63
`Chr3:14008205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:14008229`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B75,C27,C73,C74
`Chr3:14008229`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B75,C27,C73,C74
`Chr3:14008311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:14008359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,D2
`Chr3:14008375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B81,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802439.1

467 aa

234

467

Transposase_24

Peptidase_C48

PF03004 Transposase_24 2-120 aa PF02902 Peptidase_C48 336-458 aa

XP_057802440.1

467 aa

234

467

Transposase_24

Peptidase_C48

PF03004 Transposase_24 2-120 aa PF02902 Peptidase_C48 336-458 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802439.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	2	120	1.1e-12	48.9	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057802439.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	336	458	6.9e-10	39.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057802440.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	2	120	1.1e-12	48.9	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057802440.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	336	458	6.9e-10	39.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099839.1
TTCAATGTGGACGAGAATTGGAAAAATAAATGCTTGACATCGGCAAGTGCGAAATGGCGTCAACATAAGTGTAATTTGTATAAAAATCACATTGTACCGTTCCTTGATCAGCCCGAACGGTTGTATCATCCTCCATCTGATTACAGAATTGATAAGGAAGATTGGAAGGATTTTGTCATTAGTCGTATGTCAGAAGAATCTCGGAAAAAAAGTGAAGAGCTAAAGGAGAAGCAAAGACAAAATATATACCCCCACCGTAT...

XR_009099838.1
TTCAATGTGGACGAGAATTGGAAAAATAAATGCTTGACATCGGCAAGTGCGAAATGGCGTCAACATAAGTGTAATTTGTATAAAAATCACATTGTACCGTTCCTTGATCAGCCCGAACGGTTGTATCATCCTCCATCTGATTACAGAATTGATAAGGAAGATTGGAAGGATTTTGTCATTAGTCGTATGTCAGAAGAATCTCGGAAAAAAAGTGAAGAGCTAAAGGAGAAGCAAAGACAAAATATATACCCCCACCGTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017738
ATGTCAGAAGAATCTCGGAAAAAAAGTGAAGAGCTAAAGGAGAAGCAAAGACAAAATATATACCCCCACCGTATTTCACGCAAGGGATATGCCGGCTTACGTGAAGAAATGAAGGAGCAATTGACAGGTGATCAAGAGAATGATAGAGCACTTTTGTGGAAGCAAGCACGAGCAAATAAGAAAGGGGAGTTCGATGGTGAACTGTTGACAAAAACAGTTCTAAAGATTGATGAGTACCTACGACAAAAGCATGAGGGTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802439.1
MSEESRKKSEELKEKQRQNIYPHRISRKGYAGLREEMKEQLTGDQENDRALLWKQARANKKGEFDGELLTKTVLKIDEYLRQKHEGMFCSSGPSDDVLTQALEKPEHSGRVRGVGCYVTPTTYFKKSESGMGNVVQEMKEEFGKQMAEMNAKILELQQQVMMKESEEKGSCSVKNENDVEDEDEDEDDIEEVPRDKVVPFVKAPKAKSRRPHVREPMKLTATDIPMSLKMLHKYASVALFDGFTIKGSVDPLVFGHDLEV...

XP_057802440.1
MSEESRKKSEELKEKQRQNIYPHRISRKGYAGLREEMKEQLTGDQENDRALLWKQARANKKGEFDGELLTKTVLKIDEYLRQKHEGMFCSSGPSDDVLTQALEKPEHSGRVRGVGCYVTPTTYFKKSESGMGNVVQEMKEEFGKQMAEMNAKILELQQQVMMKESEEKGSCSVKNENDVEDEDEDEDDIEEVPRDKVVPFVKAPKAKSRRPHVREPMKLTATDIPMSLKMLHKYASVALFDGFTIKGSVDPLVFGHDLEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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