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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001251`

染色体: Chr03 坐标: 14416837-14421916 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001251`
名称	SmilChr03G001251
描述	protein IWS1 homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14416837 - 14421916 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017762`
GeneID	`131017762`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017762`
原始查询	`LOC131017762`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IWS1 homolog 1-like
产物	protein IWS1 homolog 1-like
Arabidopsis	`AT1G32130` (IWS1) Transcription elongation factor (TFIIS) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840105] identity=61; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0147200` (IWS1) - identity=58.6; qcov=1.07; evalue=1.24e-177; confidence=high
GO	GO:0009742 (brassinosteroid mediated signaling pathway); GO:0032784 (regulation of DNA-templated transcription elongation)
KEGG	-
Pfam	PF08711 (Med26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017762

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802460.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057802460.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057802460.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802460.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802460.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14417192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr3:14417219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A19,B110,B121,B42,B43,B60,B86,D6
`Chr3:14417919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B44,B75
`Chr3:14417962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C64,C66
`Chr3:14417996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B44
`Chr3:14418006`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B47,D2
`Chr3:14418006`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B47,D2
`Chr3:14418279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A10,B101,B15,B24,B28,B48,C48,D3
`Chr3:14418294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:14418295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B68,D2
`Chr3:14418723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B63,B83,C65
`Chr3:14419052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802460.1

505 aa

252

505

Med26

PF08711 Med26 334-375 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802460.1`	Pfam	`PF08711`	Med26	Domain	334	375	4.9e-13	49.4	TFIIS helical bundle-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946477.1
AAGCGGGTTCCTTTCCCCTGAGCCAAGAAGCCCGCGGATTTTCAAACCGAAAAAATTATTTTTATTTTTATTTATTTTCTCATGTTTGGCATAATTTCCCGTGAAATAATTCCAAATAATTCCCAGCTTCAATTGATCGTTTCGTCAATTGCTCCACCTCTTGATTCCTATTTCCTTTTATCAATCAAGTAATCGAGTAATAATTTGATTTCCTAGATTTTTCCAAAAAATTCCGGTGAATTTCACCCGAAACCACGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017762
ATGGGCTACGAAAATGACCCTTACCGTGATGAGGATGGTGAGCCATTGATGGACTTTGATGAGGATATGCCGTCGGACGGGGACGAGCCTCAGCAATATTTATTGGATGATGAAGCTGACACTGTACATGATCGCAGAGAGCGATCCACAACTCCAGTGTACAGTGACTCAAAGGCAAATCCCCGAAAGCGGTTGATTAAGAAGTACTCATCTGACAAAGTGTCACGCCCCGTGGACTTTGGTTTGGAGGATGAAGAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802460.1
MGYENDPYRDEDGEPLMDFDEDMPSDGDEPQQYLLDDEADTVHDRRERSTTPVYSDSKANPRKRLIKKYSSDKVSRPVDFGLEDEEVGGDYSGGDEDNRAGVMKESHMGGGKRKEGGEKRKSVEKKRKGEAEARNFKVKRNGGGRVRDEEADPEMKEMWDTIAGGDSEEDQDGVRTLDDDNFIDDSGVDPAHRYLSDNEHSPSRAPQAEEGEEDAEINDLFKIGKKRKKTEKSPAEVALLVENVMAELEVVAEEDAELNR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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