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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G001252

染色体: Chr03 坐标: 14444590-14449243 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G001252
名称SmilChr03G001252
描述bZIP transcription factor 16-like
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向14444590 - 14449243 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131017763
GeneID131017763
locus_tag-
NCBI NameLOC131017763
原始查询LOC131017763

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述bZIP transcription factor 16-like
产物bZIP transcription factor 16-like
ArabidopsisAT2G35530 (bZIP16)
basic region/leucine zipper transcription factor 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818118]
identity=59.2; qcov=1.02; evalue=3.38e-149; confidence=high
RiceOs12g0233800 (OsbZIP86)
-
identity=52.1; qcov=1.04; evalue=2.12e-105; confidence=high
GOGO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG-
PfamPF00170 (bZIP_1); PF03131 (bZIP_Maf); PF07716 (bZIP_2); PF07777 (MFMR); PF16596 (MFMR_assoc)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131017763

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057802461.1
2 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057802461.1
3 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057802461.1
4 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057802461.1
5 Telomere 端粒 0.00000 XP_057802461.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr3:14445684 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B52,C37
Chr3:14446119 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B118
Chr3:14447537 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B13,B33
Chr3:14447543 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A13,B8,C33
Chr3:14447552 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B13,B33
Chr3:14447594 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B125,C73
Chr3:14448454 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B41,B44
Chr3:14448457 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C87
Chr3:14448768 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802461.1
396 aa
N
1
198
396
MFMR
MFMR_assoc
bZIP_1
bZIP_Maf
bZIP_2
C
PF07777 MFMR 12-96 aa PF16596 MFMR_assoc 137-270 aa PF00170 bZIP_1 303-365 aa PF03131 bZIP_Maf 304-368 aa PF07716 bZIP_2 305-357 aa
XP_057802462.1
394 aa
N
1
197
394
MFMR
MFMR_assoc
bZIP_1
bZIP_Maf
bZIP_2
C
PF07777 MFMR 4-94 aa PF16596 MFMR_assoc 135-268 aa PF00170 bZIP_1 301-363 aa PF03131 bZIP_Maf 302-366 aa PF07716 bZIP_2 303-355 aa
XP_057802464.1
394 aa
N
1
197
394
MFMR
MFMR_assoc
bZIP_1
bZIP_Maf
bZIP_2
C
PF07777 MFMR 4-94 aa PF16596 MFMR_assoc 135-268 aa PF00170 bZIP_1 301-363 aa PF03131 bZIP_Maf 302-366 aa PF07716 bZIP_2 303-355 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057802461.1 Pfam PF07777 MFMR Family 12 96 2.3e-26 92.9 G-box binding protein MFMR
XP_057802461.1 Pfam PF16596 MFMR_assoc Disordered 137 270 1.6e-44 152.3 Disordered region downstream of MFMR
XP_057802461.1 Pfam PF00170 bZIP_1 Coiled-coil 303 365 6.2e-18 65.4 bZIP transcription factor
XP_057802461.1 Pfam PF03131 bZIP_Maf Coiled-coil 304 368 9.9e-05 23.5 bZIP Maf transcription factor
XP_057802461.1 Pfam PF07716 bZIP_2 Coiled-coil 305 357 3.5e-08 34.1 Basic region leucine zipper
XP_057802462.1 Pfam PF07777 MFMR Family 4 94 6.4e-26 91.4 G-box binding protein MFMR
XP_057802462.1 Pfam PF16596 MFMR_assoc Disordered 135 268 1.6e-44 152.3 Disordered region downstream of MFMR
XP_057802462.1 Pfam PF00170 bZIP_1 Coiled-coil 301 363 6.1e-18 65.4 bZIP transcription factor
XP_057802462.1 Pfam PF03131 bZIP_Maf Coiled-coil 302 366 0.0001 23.5 bZIP Maf transcription factor
XP_057802462.1 Pfam PF07716 bZIP_2 Coiled-coil 303 355 3.5e-08 34.1 Basic region leucine zipper
XP_057802464.1 Pfam PF07777 MFMR Family 4 94 6.4e-26 91.4 G-box binding protein MFMR
XP_057802464.1 Pfam PF16596 MFMR_assoc Disordered 135 268 1.6e-44 152.3 Disordered region downstream of MFMR
XP_057802464.1 Pfam PF00170 bZIP_1 Coiled-coil 301 363 6.1e-18 65.4 bZIP transcription factor
XP_057802464.1 Pfam PF03131 bZIP_Maf Coiled-coil 302 366 0.0001 23.5 bZIP Maf transcription factor
XP_057802464.1 Pfam PF07716 bZIP_2 Coiled-coil 303 355 3.5e-08 34.1 Basic region leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA
XM_057946478.1
GTGCGACAGTACGTGACTCGATCTCAGCCGTTAAATACTCCACGATTTGGATCCAATCATCAACCCTTAAATCCACGGTGGACACCACATCGGCGCTCTCTCTCTCTGCGCAAATCATCGGGACAACGACACAGGAGGCACGTTTGTTTTAATTGCAAAGTTGTTCGAATTCCTCTTTAGAGTTGGATAAGGAGCGGGGTTTGGTTTCCACTTTCCAGGCGTTGTGTACCTGAGTTGACTCACTGGTCGTATTGGTCGAG...
XM_057946481.1
GTGCGACAGTACGTGACTCGATCTCAGCCGTTAAATACTCCACGATTTGGATCCAATCATCAACCCTTAAATCCACGGTGGACACCACATCGGCGCTCTCTCTCTCTGCGCAAATCATCGGGACAACGACACAGGAGGCACGTTTGTTTTAATTGCAAAGTTGTTCGAATTCCTCTTTAGAGTTGGATAAGGAGCGGGGTTTGGTTTCCACTTTCCAGGCGTTGTGTACCTGAGTTGACTCACTGGTCGTATTGGTCGAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA
LOC131017763
ATGAGTAGCAGTGACGTGGATAAAGCTCCCAAGGAGGGGAAAGAACCAAAGGAGCCAAAAACTCCTTCTGCACAGGAACAGACTTCCTCTGCATCCGGTGCAGTTCCTGCTGATTGGTCTGGGTTTCAGACATATTCTCCTATGCCTCCACATGGGTTCTTAGCATCAAGTCCACAGGCACACCCCTACATGTGGGGAGTTCAGCAATTCATTCCACCGTATGGCACTCCACCACATCCATATGTTGCCATGTATCCCCA...
LOC131017763
ATGAGTAGCAGTGACGTGGATAAAGCTCCCAAGGAGGGGAAAGAACCAAAGGAGCCAAAAACTCCTTCTGCACAGACTTCCTCTGCATCCGGTGCAGTTCCTGCTGATTGGTCTGGGTTTCAGACATATTCTCCTATGCCTCCACATGGGTTCTTAGCATCAAGTCCACAGGCACACCCCTACATGTGGGGAGTTCAGCAATTCATTCCACCGTATGGCACTCCACCACATCCATATGTTGCCATGTATCCCCATGGGGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA
XP_057802461.1
MSSSDVDKAPKEGKEPKEPKTPSAQEQTSSASGAVPADWSGFQTYSPMPPHGFLASSPQAHPYMWGVQQFIPPYGTPPHPYVAMYPHGGIYAHPTMAPGSYPFSPFAMPSPNGIAEASCNVPGNMEVDGKSSEGKGKLPIKRSKGSLGSLNMITGKNDEAGKTSGATENGVHPKSGGTASEGSSEGSDENSQNESQEKSSGRPDSAEPPQSGGAPNNSQNGTSHAMANQAMAMVPIPAPAVGAVSGVPGPTTNLNIGMDY...
XP_057802462.1
MSSSDVDKAPKEGKEPKEPKTPSAQTSSASGAVPADWSGFQTYSPMPPHGFLASSPQAHPYMWGVQQFIPPYGTPPHPYVAMYPHGGIYAHPTMAPGSYPFSPFAMPSPNGIAEASCNVPGNMEVDGKSSEGKGKLPIKRSKGSLGSLNMITGKNDEAGKTSGATENGVHPKSGGTASEGSSEGSDENSQNESQEKSSGRPDSAEPPQSGGAPNNSQNGTSHAMANQAMAMVPIPAPAVGAVSGVPGPTTNLNIGMDYWG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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