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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001253`

染色体: Chr03 坐标: 14450949-14456950 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001253`
名称	SmilChr03G001253
描述	autophagy-related protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14450949 - 14456950 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017765`
GeneID	`131017765`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017765`
原始查询	`LOC131017765`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 3
产物	autophagy-related protein 3
Arabidopsis	`AT5G61500` (ATG3) autophagy 3 (APG3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836271] identity=86.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0200000` (OsATG3a) - identity=71.8; qcov=1.02; evalue=1.67e-168; confidence=high
GO	GO:0000045 (autophagosome assembly); GO:0000153 (cytoplasmic ubiquitin ligase complex); GO:0000422 (autophagy of mitochondrion); GO:0005829 (cytosol); GO:0019776 (Atg8-family ligase activity); GO:0044804 (nucleophagy)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03987 (Autophagy_act_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017765

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057802467.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802467.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802467.1`
4	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057802467.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802467.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14451568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:14451631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr3:14452154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B139,B87,D3
`Chr3:14454187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B24
`Chr3:14455064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr3:14455214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:14455689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802467.1

313 aa

156

313

Autophagy_act_C

PF03987 Autophagy_act_C 37-302 aa

XP_057802468.1

313 aa

156

313

Autophagy_act_C

PF03987 Autophagy_act_C 37-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802467.1`	Pfam	`PF03987`	Autophagy_act_C	Domain	37	302	5.9e-59	200.1	Autophagocytosis associated protein, active-site domain
`XP_057802468.1`	Pfam	`PF03987`	Autophagy_act_C	Domain	37	302	5.9e-59	200.1	Autophagocytosis associated protein, active-site domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946485.1
TTGATGGAGATATGTAGTATATATAATAACACTAAATAAATTCTAAAAAGTCAAACTTACATCCCAATCCCCAAACCTCACGCCGCCTTCCCTCAGATCTCTGCGTCTCTCTCGTCTCCTTGCCGTCGCCGCCACGTCACTGCCGGCGTCGCGCCGCCGCCTTCTCTCGGTTCTCTCGTTCATCAGCCGTAGTAGCGCGTACGATTGTACTTCGTTCCTCCTCCGCTAGCAGCGCCACTCATCGATCATCGCCGCCGCTG...

XM_057946484.1
TAATAACACTAAATAAATTCTAAAAAGTCAAACTTACATCCCAATCCCCAAACCTCACGCCGCCTTCCCTCAGATCTCTGCGTCTCTCTCGTCTCCTTGCCGTCGCCGCCACGTCACTGCCGGCGTCGCGCCGCCGCCTTCTCTCGGTTCTCTCGTTCATCAGCCGTAGTAGCGCGTACGATTGTACTTCGTTCCTCCTCCGCTAGCAGCGCCACTCATCGATCATCGCCGCCGCTGCATACACGCAGTTGGAAAGGGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017765
ATGGTGCTTTCGCAGAAAATTCATGATGCGTTCAAGGGGACTGTGGAGCGAATGACGAGCCCCCGCACCGTCTCCGCATACAAAGAGAAAGGTGTACTCAGCATCAATGAATTTATTCTCGCCGGCGATAATCTCGTCTCCAAGTGCCCCACCTGGTCTTGGGAATCAGGGGAGCCGGGCAAAAGGAAGTCATATTTGCCCCAAGATAAGCAATTCTTAATAACTAGAAATGTCCCTTGTCTTCGTAGAGCTGCTTCAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802467.1
MVLSQKIHDAFKGTVERMTSPRTVSAYKEKGVLSINEFILAGDNLVSKCPTWSWESGEPGKRKSYLPQDKQFLITRNVPCLRRAASIGEEYEAAGGEVLVDNEDDDGWLATHGKPKNNTTVEDDNLPSMETLEISKNNTIQSISSYFGGEEDDIPDMAEFEETDNLVENDPATLQTTYLVAHEPDDDNILRTRTYDVSITYDKYYQTPRVWLTGYDESRMLLQPELVLEDVSQDHARKTVTIEDHPHLPGKHASVHPCRH...

XP_057802468.1
MVLSQKIHDAFKGTVERMTSPRTVSAYKEKGVLSINEFILAGDNLVSKCPTWSWESGEPGKRKSYLPQDKQFLITRNVPCLRRAASIGEEYEAAGGEVLVDNEDDDGWLATHGKPKNNTTVEDDNLPSMETLEISKNNTIQSISSYFGGEEDDIPDMAEFEETDNLVENDPATLQTTYLVAHEPDDDNILRTRTYDVSITYDKYYQTPRVWLTGYDESRMLLQPELVLEDVSQDHARKTVTIEDHPHLPGKHASVHPCRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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