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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001258`

染色体: Chr03 坐标: 14493913-14497192 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001258`
名称	SmilChr03G001258
描述	probable phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14493913 - 14497192 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017769`
GeneID	`131017769`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017769`
原始查询	`LOC131017769`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
产物	probable phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
Arabidopsis	`AT3G18030` (HAL3A) HAL3-like protein A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821327] identity=80.4; qcov=0.682; evalue=9.48e-121; confidence=high
Rice	`Os06g0199500` (OsHAL3) - identity=83.6; qcov=0.639; evalue=2.79e-111; confidence=high
GO	GO:0004633 (phosphopantothenoylcysteine decarboxylase activity); GO:0010181 (FMN binding); GO:0015937 (coenzyme A biosynthetic process); GO:0071513 (phosphopantothenoylcysteine decarboxylase complex)
KEGG	smil00770 (Pantothenate and CoA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02441 (Flavoprotein)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017769

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802471.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057802471.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802471.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802471.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802471.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14494715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B44,B81,C86
`Chr3:14494752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B33,C33
`Chr3:14494797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B44,B7,C71,C86
`Chr3:14494919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:14495610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B57
`Chr3:14495692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:14495768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B104,D4,D9
`Chr3:14496393`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A11,A2,A3,B118,B124,B135,B49,B77,B79,B8,B9,B97,B99,C12,C22,C26,C3,C42,C47,C59,C60,C83
`Chr3:14496394`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A11,A2,A3,B118,B124,B135,B49,B77,B79,B8,B9,B97,B99,C12,C22,C26,C3,C42,C47,C59,C60,C83
`Chr3:14496402`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A11,A2,A3,B118,B124,B135,B49,B77,B79,B8,B9,B97,B99,C12,C22,C26,C3,C42,C47,C59,C60,C83
`Chr3:14496414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B3,B44,C86
`Chr3:14496435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,C24,C41,C78,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802471.1

277 aa

138

277

Flavoprotein

PF02441 Flavoprotein 91-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802471.1`	Pfam	`PF02441`	Flavoprotein	Domain	91	268	1.6e-52	178.7	Flavoprotein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099853.1
ACCTTGCTAAAATAATAGACTTGGAGAGCTATGCCCTTATCACCTATGGGCTATGACTATGGGTTTATTTTGAATAATTTAATTTTACTGCTAACTACTTCACTTTCCCTCTTCTTCTGCTCTATCACTTTCATTGAGGGTTTTCTCACATCATTCTTTTATCCTTCAGCCCTAATTCCCCTTCTCCCTCGTCTGCATCTTCAATTCCAGAGTTTGGGGACACAACAGCAGATTCAAGAAAAGGATATGGCACATGTAGA...

XR_009099854.1
ACCTTGCTAAAATAATAGACTTGGAGAGCTATGCCCTTATCACCTATGGGCTATGACTATGGGTTTATTTTGAATAATTTAATTTTACTGCTAACTACTTCACTTTCCCTCTTCTTCTGCTCTATCACTTTCATTGAGGGTTTTCTCACATCATTCTTTTATCCTTCAGCCCTAATTCCCCTTCTCCCTCGTCTGCATCTTCAATTCCAGAGTTTGGGGACACAACAGCAGATTCAAGAAAAGGATATGGCACATGTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017769
ATGCCCTTATCACCTATGGGCTATGACTATGGGTTTATTTTGAATAATTTAATTTTACTGCTAACTACTTCACTTTCCCTCTTCTTCTGCTCTATCACTTTCATTGAGGGTTTTCTCACATCATTCTTTTATCCTTCAGCCCTAATTCCCCTTCTCCCTCGTCTGCATCTTCAATTCCAGAGTTTGGGGACACAACAGCAGATTCAAGAAAAGGATATGGCACATGTAGAACCTGAGAATATGGAGATGAACTTGTATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802471.1
MPLSPMGYDYGFILNNLILLLTTSLSLFFCSITFIEGFLTSFFYPSALIPLLPRLHLQFQSLGTQQQIQEKDMAHVEPENMEMNLYQVNSAVRRPRILLAASGSVAAIKFANLCHCFSEWAEVKAVATQASLHFVDRIALPKDVILYTDEDEWSSWKKIGDNVLHIELRKWADIMVIAPLSANTLAKIAGGLCDNLLTCIVRAWDYSKPMFVAPAMNTLMWNNPFTERHLMGIDDLGISLIPPVKKRLACGDYGNGAMAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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