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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001277`

染色体: Chr03 坐标: 14949826-14953038 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001277`
名称	SmilChr03G001277
描述	B2 protein-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	14949826 - 14953038 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017782`
GeneID	`131017782`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017782`
原始查询	`LOC131017782`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B2 protein-like
产物	B2 protein-like
Arabidopsis	`AT5G42050` (AT5G42050) DCD (Development and Cell Death) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834210] identity=56.5; qcov=1.13; evalue=2.7e-118; confidence=high
Rice	`Os01g0550300` (B1156H12.27-2) - identity=55.1; qcov=1.07; evalue=1.25e-102; confidence=high
GO	GO:0034976 (response to endoplasmic reticulum stress)
KEGG	-
Pfam	PF10539 (Dev_Cell_Death)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017782

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802487.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802487.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057802487.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057802488.1`
5	P-body	P-body	0.60000	`XP_057802488.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:14950788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B108,B99,C23
`Chr3:14950815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C71,D1
`Chr3:14950854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C44
`Chr3:14950971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B32,C23,C49
`Chr3:14951071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B52,B70
`Chr3:14951076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr3:14951112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B20,B71,B98
`Chr3:14951163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr3:14951178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:14951277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:14951361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B90,C76
`Chr3:14951556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B86,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802487.1

335 aa

168

335

Dev_Cell_Death

PF10539 Dev_Cell_Death 189-309 aa

XP_057802488.1

321 aa

160

321

Dev_Cell_Death

PF10539 Dev_Cell_Death 189-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802487.1`	Pfam	`PF10539`	Dev_Cell_Death	Domain	189	309	3.6e-39	134.2	Development and cell death domain
`XP_057802488.1`	Pfam	`PF10539`	Dev_Cell_Death	Domain	189	316	2.3e-40	138.0	Development and cell death domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946505.1
ATGTTACTACAAATTTAACTTTCACATTAATTTTTTTTTATTTCGAAAAAAGTTGTTTTGAATACAATCTTTCGAAAAATATGGCTATATTTTTAAAATTTATAGTTATTCTTTTTATACAATTTTACATTGAATACATAATAATGCAGATATTTACTAAGTGATTCGTTATTCTGTTGCCTTATTCTATAAAGACACGATAAAACTTAAACTTTTTCTAGGTTAAATTTTTGTATATAAAGGTTATTAGCATCAAGATA...

XM_057946504.1
TTTTCTTCTTCCTTAGCGCACAGTACACCCCATACTTTTCCACACTAGCTTTGACAAATCCACACGCTATCCCTCTCGTCTCCTTCCTCGCACCTTCGCCCCCTTTTCGCCCCCATTTATACCCCACTCTCCTCCTCTCTCCTCTTCCTTCATCTTCATCTTCACCAATTCCTCGATTACTGTCTGCGCCAATTCAATTTCAACTACCGCGATTTTGAATTCTTCAATGGAGAACAATCAGTCTTCGTTTTGGCAGTTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017782
ATGGAGAACAATCAGTCTTCGTTTTGGCAGTTCAGCGACAACCTCCGCCTCCAGACGGGGAGCCTCGCCGATCTCTCGCTCAACGACTCAATCTGGAGCACCAACTACGCGGCCAAGCGGAGCGCCGAGGAGCGCCGCAACTTCGACTTCCGCAACGCCGGCGAAGCCACCTTCGGTAACGATCTCAAGTCGGATTTCAACGCCGGGTTCAGCAACGACGCGTGGAAGGCGCCGATCAACGATAGCTTCAATTACTCCGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802487.1
MENNQSSFWQFSDNLRLQTGSLADLSLNDSIWSTNYAAKRSAEERRNFDFRNAGEATFGNDLKSDFNAGFSNDAWKAPINDSFNYSGYGSGSAGLNGGFNKGVYTTPPPSMNFNSYYSKGKGFANNNAVMNGKINRGKNDEEHGGKLGKKNRGNKESGKDSNGENKTAVDKRFKTLPPAEALPRNETIGGYIFVCNNDTMAENLKRQLFGLPPRYRDSVRAITPGLPLFLYNYSTHQLHGVFEAASFGGTNIDPTAWEDK...

XP_057802488.1
MENNQSSFWQFSDNLRLQTGSLADLSLNDSIWSTNYAAKRSAEERRNFDFRNAGEATFGNDLKSDFNAGFSNDAWKAPINDSFNYSGYGSGSAGLNGGFNKGVYTTPPPSMNFNSYYSKGKGFANNNAVMNGKINRGKNDEEHGGKLGKKNRGNKESGKDSNGENKTAVDKRFKTLPPAEALPRNETIGGYIFVCNNDTMAENLKRQLFGLPPRYRDSVRAITPGLPLFLYNYSTHQLHGVFEAASFGGTNIDPTAWEDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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