当前解析结果
SmilChr03G001283| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001283 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001283 |
| 描述 | calcineurin B-like protein 7 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 15014583 - 15017645 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017789 |
|---|---|
| GeneID | 131017789 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017789 |
| 原始查询 | LOC131017789 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | calcineurin B-like protein 7 |
| 产物 | calcineurin B-like protein 7 |
| Arabidopsis | AT1G64480 (CBL8)calcineurin B-like protein 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842756] identity=60.8; qcov=0.977; evalue=5.58e-92; confidence=high |
| Rice | Os02g0291000 (OsCBL7)- identity=61.8; qcov=0.968; evalue=2.61e-91; confidence=high |
| GO | GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0019722 (calcium-mediated signaling); GO:0019900 (kinase binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017789 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057802497.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.60000 | XP_057802498.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057802498.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057802497.1 |
| 5 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057802498.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:15017225 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B20,D1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057802497.1PF13499
EF-hand_7 111-180 aa
PF13833
EF-hand_8 124-183 aa
PF13202
EF-hand_5 157-181 aa
PF00036
EF-hand_1 157-183 aa
XP_057802498.1PF13499
EF-hand_7 111-180 aa
PF13833
EF-hand_8 124-183 aa
PF13202
EF-hand_5 157-181 aa
PF00036
EF-hand_1 157-183 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057802497.1 |
Pfam | PF13499 |
EF-hand_7 | Domain | 111 | 180 | 6.5e-18 | 65.6 | EF-hand domain pair |
XP_057802497.1 |
Pfam | PF13833 |
EF-hand_8 | Domain | 124 | 183 | 2.4e-12 | 47.1 | EF-hand domain pair |
XP_057802497.1 |
Pfam | PF13202 |
EF-hand_5 | Domain | 157 | 181 | 4.4e-15 | 55.1 | EF hand |
XP_057802497.1 |
Pfam | PF00036 |
EF-hand_1 | Domain | 157 | 183 | 1.6e-20 | 71.8 | EF hand domain |
XP_057802498.1 |
Pfam | PF13499 |
EF-hand_7 | Domain | 111 | 180 | 5.8e-19 | 68.9 | EF-hand domain pair |
XP_057802498.1 |
Pfam | PF13833 |
EF-hand_8 | Domain | 124 | 183 | 1.5e-12 | 47.8 | EF-hand domain pair |
XP_057802498.1 |
Pfam | PF13202 |
EF-hand_5 | Domain | 157 | 181 | 2.4e-15 | 55.9 | EF hand |
XP_057802498.1 |
Pfam | PF00036 |
EF-hand_1 | Domain | 157 | 183 | 8.7e-21 | 72.6 | EF hand domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。