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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001286`

染色体: Chr03 坐标: 15061379-15065070 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001286`
名称	SmilChr03G001286
描述	uncharacterized SmilChr03G001286
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15061379 - 15065070 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017791`
GeneID	`131017791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017791`
原始查询	`LOC131017791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GRF zinc finger / Zinc knuckle protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841933]; symbol=AT1G54930; hit=AT1G54930; species=arabidopsis; confidence=low
产物	GRF zinc finger / Zinc knuckle protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841933]; symbol=AT1G54930; hit=AT1G54930; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G54930` (AT1G54930) GRF zinc finger / Zinc knuckle protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841933] identity=36.8; qcov=0.364; evalue=4.75e-11; confidence=low
Rice	`Os03g0786500` - identity=29.6; qcov=0.441; evalue=9.4e-08; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802500.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802500.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802500.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802500.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802500.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15061639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B57
`Chr3:15061863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:15061966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B74,C71
`Chr3:15064416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A18,B105,C32,C68
`Chr3:15064416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B105,C32,C68
`Chr3:15064540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,B98
`Chr3:15064560`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B101,B11,B120,B135,B16,B74,C40,C48,C58,C62
`Chr3:15064657`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	177	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B102,B104,B105,B107,B108,B109,B11,B112,B117,B118,B119,B121,B122,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B134,B135,B136,B138,B140,B15,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B36,B37,B40,B41,B42,B44,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B72,B73,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B99,C1,C12,C13,C15,C16,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C26,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C37,C38,C39,C4,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C66,C67,C68,C72,C77,C78,C79,C81,C83,C85,C86,C9,D10,D11,D3,D5,D7,D8
`Chr3:15064681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A5,B38,B39
`Chr3:15064738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B68,B85,D2
`Chr3:15064744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,B98
`Chr3:15064760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946517.1
TTTTTTTTTTTGAGAGAGAGATTTGGGATATCTTTTGGTAAGCAGTGAATCGTGATGCAGAGCAAAGTCTGTGACCGACTTACCATAAACAGTAAGCAGATGTGAAGGAAAAGTGGAGAAACGCTCCGCTCCATCAAATGAAAGGGCTCTGCGCGGAACTCAAACCTTGTCTCTCTCTCTCAACATTCTTACTCCCTTAGAGAGAGAGATAGAGAATTTAAGTAGGCTTGCGAAATGGAAGGTGTAGAGAAACGCTACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017791
ATGGAAGGTGTAGAGAAACGCTACGAGTGGCGCGTCATCTGCTCCAACGCCAAGTGCAGCGCCGGAATTTGCCAACTGAAACGCTCCACCACTCCGCAAAGCCGCGGCTGCTACTTCTTCACTTGCCCCGCCCGCACACACAAATCTTTCAAGTGGGCAAACAAGGTTGAACCCCATGAATGGATGCCAGTGCCTTATTGCGGGGGTTGTAACGCCGGAGTTTGCCGGGTCAAGAGGGAAACCTCCGGACCCAATGCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802500.1
MEGVEKRYEWRVICSNAKCSAGICQLKRSTTPQSRGCYFFTCPARTHKSFKWANKVEPHEWMPVPYCGGCNAGVCRVKRETSGPNAGRLMFLCTIKEGQGSCGYRVWQDELEKMEARNREEEEKMNPLQSAMVNCNKASSEATNTDHTSSPLIESLNRVRAEATNNGKPLKVLQEEISSTMDRLFQIGSQVSCCDVEMKELELQLESVSKNKEALEAEYLVVSKELEESRRLLELKEVEQNAAFDRASMSSLLSCSISNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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