当前解析结果
SmilChr03G001312| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001312 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001312 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001312 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 15395343 - 15396958 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131017815 |
|---|---|
| GeneID | 131017815 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017815 |
| 原始查询 | LOC131017815 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017815 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802533.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057802533.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802533.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802533.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057802533.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:15395511 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C11 |
Chr3:15395530 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B52,C25,C82,C87 |
Chr3:15395543 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | C32,C35,C36,C68,D4 |
Chr3:15395543 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | C32,C35,C36,C68,D4 |
Chr3:15395558 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A11,A22,A3,B109,B133,B36,D5 |
Chr3:15395564 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B138,B79,D10 |
Chr3:15395564 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B138,B79,D10 |
Chr3:15395569 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:15395575 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B139,B98,C18,C22,C44 |
Chr3:15395577 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C86,C9 |
Chr3:15395602 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C32,C35,C36 |
Chr3:15395603 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C32,C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。