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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001329`

染色体: Chr03 坐标: 15541355-15546311 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001329`
名称	SmilChr03G001329
描述	protein SEH1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15541355 - 15546311 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017825`
GeneID	`131017825`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017825`
原始查询	`LOC131017825`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SEH1-like
产物	protein SEH1-like
Arabidopsis	`AT1G64350` (SEH1H) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842741] identity=62.5; qcov=0.994; evalue=5.9e-147; confidence=high
Rice	`Os01g0620100` (OsWD40-19) - identity=58.1; qcov=0.985; evalue=3.07e-138; confidence=high
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0031080 (nuclear pore outer ring); GO:0034198 (cellular response to amino acid starvation); GO:0035859 (Seh1-associated complex); GO:1904263 (positive regulation of TORC1 signaling)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017825

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802546.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802546.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802546.1`
4	Nuclear pore complex	核孔复合体	0.20000	`XP_057802546.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15541640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr3:15542092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:15542550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B10,B2,C12
`Chr3:15543033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr3:15543106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B40,C53
`Chr3:15545278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:15545627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:15545646`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr3:15545646`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr3:15545966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802546.1

325 aa

162

325

WD40

PF00400 WD40 273-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802546.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	273	307	1.5e-12	48.2	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946563.1
GTGGGCTTCTTCATGATGGGCCGGGTTAAAGAACTGAAGCCCATGCTAAAGTTTTATTTAGGGGGAAATTAAATTTAATTAAATAAATATTCCAAAACCCCCAAATTGAAATAGGGTTTTAGAAACTAAGACCGCGCTCTAGTAGAGTGTTCATCCCCAATTCGTTCCAGCTTCTTGGATTGCATGATAAGACCGCGTTTCCGGTTTCTAAGTCGTTTTATGATCGATTTATAGCTAGAAATATAGATGGATAAGTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017825
ATGGATAAGTCCATTTTGGTACTTGATAAAGGTACAAGATGCACAGCTTGGAATTACAGCGGCGAGAGATTGGTTGCTGGACTCGTTGATGGTTCGTTGGCCGTTTATGATTCAACTGATCCAGCTTCTTCAAACTTTACTTGTACCTCCAGATTTAAGGCACAAAATTGCGGCATTGTGAAAGTGGTCTGGGCTCCGCCAGAATACGGGGATGCGGTTGCTTGCATTAGTGAAGATGGGAATTTGTCATTGTGGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802546.1
MDKSILVLDKGTRCTAWNYSGERLVAGLVDGSLAVYDSTDPASSNFTCTSRFKAQNCGIVKVVWAPPEYGDAVACISEDGNLSLWEEVMEDTEDPHWKMCKCFDRNTSQVLDVQFGGGQTCLKLVAAYSDGQVKIYELLDTLELEKWQLQAEFQNVIDLVSKFGNVSSLSASVSWNPQRSEVQQSSFVLGFSSNTPTLNSAKVWEFDLDHQRWLPVAELSLPEDKGDQVSSVAWAPNIGRPYELIAVATQKGISIWHLGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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