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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001349`

染色体: Chr03 坐标: 15731258-15734814 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001349`
名称	SmilChr03G001349
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15731258 - 15734814 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017840`
GeneID	`131017840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017840`
原始查询	`LOC131017840`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=32.5; qcov=0.941; evalue=8.12e-62; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=38.1; qcov=0.708; evalue=3.72e-65; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802561.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802561.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802561.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802561.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15731385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B74,C17,C23,C64,C76
`Chr3:15731414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B105
`Chr3:15731434`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A19,A23,A24,B120,B123,B131,B20,B29,B30,B56,B60,B96,C40,C52,C57,C65,C74,D10
`Chr3:15731452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A11,B103,B109,B119,B126,B138,B17,B32,B33,C19
`Chr3:15731507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B75
`Chr3:15731700`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	73	A10,A16,A18,A22,A7,A8,A9,B10,B103,B106,B108,B11,B110,B111,B112,B115,B12,B128,B131,B133,B136,B16,B18,B19,B20,B21,B24,B28,B36,B40,B45,B46,B48,B68,B70,B71,B72,B73,B8,B81,B83,B93,B95,B97,B98,C12,C13,C14,C22,C25,C27,C3,C31,C32,C36,C42,C45,C47,C49,C5,C51,C53,C55,C57,C59,C60,C68,C70,C82,D2,D4,D5,D8
`Chr3:15731701`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	69	A10,A16,A18,A22,A7,A8,A9,B10,B106,B108,B11,B110,B112,B115,B12,B128,B131,B133,B136,B16,B18,B19,B20,B21,B24,B28,B40,B45,B46,B48,B68,B70,B71,B72,B73,B8,B81,B83,B93,B95,B97,B98,C12,C13,C14,C22,C25,C27,C3,C31,C32,C36,C42,C45,C47,C49,C51,C53,C55,C57,C59,C60,C68,C70,C82,D2,D4,D5,D8
`Chr3:15731702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B126,C19
`Chr3:15731723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B44,B48
`Chr3:15731819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B21,B23,B93,C49
`Chr3:15731893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B35,B99,D11
`Chr3:15731904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802561.1

493 aa

246

493

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 155-326 aa PF23559 WHD_DRP 403-473 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802561.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	155	326	5.5e-38	131.0	NB-ARC domain
`XP_057802561.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	403	473	1.8e-19	70.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946578.1
AAAGAAAGAAAAGAAAAATTGAACATATCACAACTCACAAGCAGTAAACAATGATTTTGAGAAATTTGCTGTGTAAAATCGAGATGGCTTATGAAGCTCTTGATAACCTGCAACAAACCTTAGATCAGATCCTAGAATACCGTGACGATCTCGTCACTCATTCTGTGAAACAAGAAATTTTATCCATCCGCGTCCAAGCTGCTGTCTTGCAGTTGAATCTCAAACTTTATCCAAACAAAGGGAAAATCAGAGAGGCAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017840
ATGATTTTGAGAAATTTGCTGTGTAAAATCGAGATGGCTTATGAAGCTCTTGATAACCTGCAACAAACCTTAGATCAGATCCTAGAATACCGTGACGATCTCGTCACTCATTCTGTGAAACAAGAAATTTTATCCATCCGCGTCCAAGCTGCTGTCTTGCAGTTGAATCTCAAACTTTATCCAAACAAAGGGAAAATCAGAGAGGCAGCGAATACAGCATATGAGATTATCGAATATTTCTTTTTTGGGGAATATCTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802561.1
MILRNLLCKIEMAYEALDNLQQTLDQILEYRDDLVTHSVKQEILSIRVQAAVLQLNLKLYPNKGKIREAANTAYEIIEYFFFGEYLSDCGSTEPTVILAKKLREVAERVEATVGDVVDYIKGKASLSSATHSPDVSSSSGSAITSSKDDDVVGFEEDLKMIKNRLLWGPSTLQVNPIVGTGGIGKTTLAKLAYNDPLIVQNFSTCAWVTISQDHSVERIVLNLLDSMKGISAVRDGESDTPMETLICEYLTGRRYLIVMD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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