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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001413`

染色体: Chr01 坐标: 27725212-27727241 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001413`
名称	SmilChr01G001413
描述	uncharacterized SmilChr01G001413
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27725212 - 27727241 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017843`
GeneID	`131017843`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017843`
原始查询	`LOC131017843`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	formin-like protein (DUF1005) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837537]; symbol=AT1G10020; hit=AT1G10020; species=arabidopsis; confidence=high
产物	formin-like protein (DUF1005) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837537]; symbol=AT1G10020; hit=AT1G10020; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G10020` (AT1G10020) formin-like protein (DUF1005) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837537] identity=46.8; qcov=0.872; evalue=2.51e-117; confidence=high
Rice	`Os07g0133500` - identity=44.4; qcov=0.896; evalue=1.4e-105; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06219 (DUF1005)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017843

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802569.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802569.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802569.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802569.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27725518`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A3,B131,C18,C47
`Chr1:27725518`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A3,B131,C18,C47
`Chr1:27725599`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C35,D11
`Chr1:27725599`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C35,D11
`Chr1:27725621`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	78	A10,A13,A14,A18,A20,A21,A23,A3,A4,B1,B10,B101,B102,B107,B114,B117,B125,B127,B128,B135,B137,B139,B140,B16,B17,B22,B25,B28,B3,B30,B38,B39,B41,B42,B43,B51,B52,B53,B58,B60,B62,B63,B65,B68,B81,B87,B90,B92,C10,C13,C15,C24,C25,C26,C27,C28,C31,C44,C45,C47,C50,C54,C56,C60,C65,C70,C72,C73,C79,C82,C85,C86,D1,D3,D5,D6,D7,D9
`Chr1:27725637`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A21,B111,B122,B75,B94,C64,C66,C7,D1
`Chr1:27725653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B91,C12,C55
`Chr1:27725804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C1
`Chr1:27725942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C39
`Chr1:27726042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:27726078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:27726080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802569.1

530 aa

265

530

DUF1005

PF06219 DUF1005 108-525 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802569.1`	Pfam	`PF06219`	DUF1005	Family	108	525	6.4e-149	497.5	Protein of unknown function (DUF1005)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946586.1
TTATAATTTAATAACTTAATAATCACGAGTATTAAAATGAGATTATCTTTTTCTTTTAAACTACACTACAGTCTAGAAAAAATAAATACTTTTTAATCGCATAACATTGTTGTCAAAAAATTGGCAGCGAAGAAAGTTGGGTGAAAAGTGGCGCGGAATGATCCAATCCTCGTCGACCTATATATCTCCCAAATTGAGACAGCTGTCGCCCTTCAGAAAAAGACACATGTTTGTATCCCAGCTGTCCAATCTAACACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017843
ATGATCCAATCCTCGTCGACCTATATATCTCCCAAATTGAGACAGCTGTCGCCCTTCAGAAAAAGACACATGTTTGTATCCCAGCTGTCCAATCTAACACTCATCACTCGAAGCTCAAAGCAAACCAATGACAAGCTTCAACTAAACGACAAAACCCAAACTAGAAATTGTATAGCGATTCCGATTGCTGGCACTACGCTACGTGCATCACAGCTCACCCCGCACGCTCATTCTCATGCTCATGCTCATGCTCTTATATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802569.1
MIQSSSTYISPKLRQLSPFRKRHMFVSQLSNLTLITRSSKQTNDKLQLNDKTQTRNCIAIPIAGTTLRASQLTPHAHSHAHAHALIYIYTSLISSFSLPLSIHTRIDMDPCPFVRIAVGDLALNLPHKPHLSFYSKFKLRGFPSQLSEIPCAAAVDARIHACFTLKKSELEKLAEKSSKFSSLRIEIYRRSGGESKGCGLVMKSGKLLGCVVVQLDLKSINVENRACPIRNGWVPIGGGGEVKLHMNVRAEPDPRFVFQF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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