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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001402`

染色体: Chr03 坐标: 16614216-16616372 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001402`
名称	SmilChr03G001402
描述	uncharacterized SmilChr03G001402
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16614216 - 16616372 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017856`
GeneID	`131017856`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017856`
原始查询	`LOC131017856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36.5; qcov=0.466; evalue=1.08e-42; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017856

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802583.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057802583.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802583.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802583.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16614382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr3:16614435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B44,C14
`Chr3:16614452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A19,B102,B103,B109,B125,B131,B21,B28,B29,B36,B39,B4,B46,B47,B48,B52,B53,B57,B64,B68,B74,B81,B95,C20,C30,C39,C42,C43,C56,C6,C76,C9
`Chr3:16614572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B40,D2
`Chr3:16614602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A2,A21,B133,B137,B138,B16,B20,B26,B33,B40,B42,B43,B46,B66,B74,B90,B91,B92,C14,C18,C34,C65,C72,C76,C80,D9
`Chr3:16614612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr3:16614662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B11,B76,B79,C43
`Chr3:16614671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A1,B111,B117,B12,B120,B129,B18,B2,B26,B66,B68,B70,C12,C24,C37,C78,D2
`Chr3:16614679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B100,B2,C45
`Chr3:16614693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr3:16614759`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A14,B122,B53,B79,B96
`Chr3:16614759`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A14,B122,B53,B79,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802583.1

459 aa

230

459

DUF7769

PF24964 DUF7769 6-59 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802583.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	6	59	5.6e-08	33.0	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946600.1
CGGCCACATTCTTTTTGGCACGGAGATTAAGAAATGTGTAGTTAGTGTTTAAGTTAGTGGGGTCCCTTTCCATTTGACTTTTCCATGATACTTAATTGAAATTTTAATCCCAACCAACTTTACAACTACTTTTTTTTTATTTTCAATTAATTTATTTTAGATCATTAATTTAAAAAAACTGTAAACTCTATGATTACTCAAAAAATTAAATATGTGGCAGTTTGTGATTCCTTTTCATTAATCAAGGTAAACTCAAATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017856
ATGGTGAGCAAAAACCTATCTAATCAAGATAGAAACAAAATAGTGCAGTTTCTTTTAGCCAATTTGAAGAATGGCAAGCCTAGCTATGGAGTCATGAAGGAGGCTGCCACAATCTTCAATTCCTCCCAACGCAACATTACTCGTCTTTGGGCAGCTGCGAAGAAACAAAAAGAAAGTGGTCAGCAAATATATCTATCAAGTGCGAAACCAGGAGCAGCTAGAAGAAAAAGAGTTACTGTCGATATAGAGCTAATTCAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802583.1
MVSKNLSNQDRNKIVQFLLANLKNGKPSYGVMKEAATIFNSSQRNITRLWAAAKKQKESGQQIYLSSAKPGAARRKRVTVDIELIQSLELHKRSTIRRLAVGINQSKSTVWRWVNKGLIRAHSSAIKPDLTAPNKLLRLRFSLEALEFDRIMLALKFKAMDNTIHIDEKWFYITKTAHRFYLTPAEGDPHRTCKSKSFIKKVMFVCAVCRPIFSDAGECLFDGKIGIFPLTEQVPAKRNSKNRPAGTMETKPIQSITMQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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