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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001399`

染色体: Chr03 坐标: 16604416-16606361 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001399`
名称	SmilChr03G001399
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16604416 - 16606361 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017857`
GeneID	`131017857`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017857`
原始查询	`LOC131017857`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=27.4; qcov=1.04; evalue=5.71e-28; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=29.3; qcov=0.987; evalue=2.86e-33; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017857

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057802584.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802584.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802584.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802584.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802584.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16604880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:16604897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:16605032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B106,B110,B45,C70
`Chr3:16605052`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B114,B137,C19
`Chr3:16605052`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B114,B137,C19
`Chr3:16605054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B137,C19
`Chr3:16605136`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B64
`Chr3:16605136`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B64
`Chr3:16605167`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B105,B126
`Chr3:16605167`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B105,B126
`Chr3:16605215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B89,B90,C50,C72
`Chr3:16605266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B89,B90,C50,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802584.1

446 aa

223

446

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 1-73 aa PF23598 LRR_14 128-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802584.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	1	73	1.8e-19	70.2	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802584.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	128	317	1.2e-23	84.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946601.1
AGAAGCTGCAAAGGGCTGCCCCTCGCAATCGTGGTGGTTGCAGGGCTCCTATCCACGGTCAGCAATAATCCAGCTTCATGGAGGGAAATTGCACAAAATGTAAACTCAGTTACTACTGAGAAACAATTTGAAAAGATATTTTCTCTGAGTTACACCCACTTGCCTCATTATCTAAGGCCATGTTACTTGTACATTGGGATGTTTCCGGAAGATTGTGAGGTCCGTGTCTCAAAACTCATCAAACTATGGGTAGCTGAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017857
ATGTTTCCGGAAGATTGTGAGGTCCGTGTCTCAAAACTCATCAAACTATGGGTAGCTGAGGGATTCTTGAGAGGTCGGAACAAATTTAAAAGCTTAGAAGACGCGGCGGTGGAGTGTTTGGAAGATCTTGTCAGGAGAAATCTTGTTTTGGTCACCAAGAGAAAGTGTGATGGCAGAATCAAGAGCTGCAGCCTCCATGATCTGATGCGAGACTTGTGCATAAGAGAGGCGCATGACGACAAGTTTCTTGTGAATCTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802584.1
MFPEDCEVRVSKLIKLWVAEGFLRGRNKFKSLEDAAVECLEDLVRRNLVLVTKRKCDGRIKSCSLHDLMRDLCIREAHDDKFLVNLSRGRAISTQRGNQLRVSVTSSGLPYFSKLYGLTIQTILCFHGISVANMLEGFRLLRVLDAGDVYVSSLPDQLFDLFYLAYLAICYLGRIPTAISKLRNLEILSLHAKNEWMHFRLHSIRLPQEIWTMTRLRHLVFYGRLPNPEGITSSSLENLQTLSIVSHSMCSEWILRMIPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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