当前解析结果
SmilChr03G001389| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001389 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001389 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001389 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 16471407 - 16494841 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017864 |
|---|---|
| GeneID | 131017864 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017864 |
| 原始查询 | LOC131017864 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017864 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057802594.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057802595.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057802594.1 |
| 4 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057802594.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057802595.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:16471651 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B36 |
Chr3:16471711 |
ATT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B6,C20,C45,C64,C74 |
Chr3:16471711 |
ATT |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B6,C20,C45,C64,C74 |
Chr3:16471713 |
TCA |
* |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B6,C20,C45,C64,C74 |
Chr3:16471730 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B6,B88,C20,C45,C64,C74 |
Chr3:16471750 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr3:16471858 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B88 |
Chr3:16481007 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | B17,B21,B77,B9,B90,B92,B99,C28,C5,C75 |
Chr3:16481057 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A25,B121,B127,B128,B130,B37,B63,C29,C79 |
Chr3:16481066 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A16,A3,B133,B24,B27,B29,B34,B46,B49,C17,C32,C68,C86,D10 |
Chr3:16485857 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 16 | B10,B110,B112,B115,B131,B133,B21,B28,B36,B83,B95,C32,C49,C59,C60,C68 |
Chr3:16485858 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 42 | A19,A5,A7,B100,B107,B109,B119,B122,B124,B127,B139,B18,B26,B31,B37,B54,B55,B61,B62,B7,B75,B76,B79,B80,B82,B87,B88,B90,B92,B96,C11,C3,C40,C43,C44,C62,C63,C69,C77,C8,C83,C85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。