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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001411`

染色体: Chr01 坐标: 27705636-27708347 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001411`
名称	SmilChr01G001411
描述	amino acid permease 6-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27705636 - 27708347 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017865`
GeneID	`131017865`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017865`
原始查询	`LOC131017865`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid permease 6-like
产物	amino acid permease 6-like
Arabidopsis	`AT1G58360` (AAP1) amino acid permease 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842205] identity=58.4; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0134000` (OsAAP6) - identity=55.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017865

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802597.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057802597.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057802597.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802597.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802597.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27706071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B108,C23
`Chr1:27706089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C3,C83,D8
`Chr1:27706091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C34,C76
`Chr1:27706638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:27706686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C10,C3,C79,C83,D8
`Chr1:27707004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:27707454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B70
`Chr1:27707468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:27707511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B60,B85,C10,C9
`Chr1:27707545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B13,B60,C9
`Chr1:27707577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:27707637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802597.1

467 aa

234

467

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 29-454 aa

XP_057802598.1

467 aa

234

467

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 29-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802597.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	29	454	2.5e-105	353.2	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057802598.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	29	454	2.5e-105	353.2	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946614.1
ATGCCATAGATCACGCATCTAAGATCTATCATATCCAACAATAAAGCTAGGCATGCATGCTTAGACACCATGAATTCTATTTATGCATAAAATCTGCATATACAAGGTTTATGATAATTTAGGTCTGTCTAAATCAAAAACGCTTCAAATGTGGCTTTCCTTCACTCTTTTAGAGAAATCCCTTTACTTCCATTTTTTAGGAACCTTTCCAATTTCTATTAAGAGCTAGCTAACAACAATTCTTTCATTTCCCACTGTCA...

XM_057946615.1
ATGCCATAGATCACGCATCTAAGATCTATCATATCCAACAATAAAGCTAGGCATGCATGCTTAGACACCATGAATTCTATTTATGCATAAAATCTGCATATACAAGGTTTATGATAATTTAGGTCTGTCTAAATCAAAAACGCTTCAAATGTGGCTTTCCTTCACTCTTTTAGAGAAATCCCTTTACTTCCATTTTTTAGGAACCTTTCCAATTTCTATTAAGAGCTAGCTAACAACAATTCTTTCATTTCCCACTGTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017865
ATGATGAATGTAGAAAGTTTGAACATCGAAGCGCCGCCGGGATACGATACATCCGTCGTCGATGATGATGGCCGTCCCAAGAGAACTGGAAACGTATGGTCCGCAGGGGCCCACATAATAACAGCGGTAATCGGGTCGGGCGTATTGACACTGGCATGGGCCATAGCTCAAATGGGTTGGATCGCTGGGCCCACCGCCCTCCTCGTCTTCTCTCTCATTACTCTCTTCACCTCCACCTTACTCGCCGACTGCTATCGCGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802597.1
MMNVESLNIEAPPGYDTSVVDDDGRPKRTGNVWSAGAHIITAVIGSGVLTLAWAIAQMGWIAGPTALLVFSLITLFTSTLLADCYRAADGTRNYVYRDAVKAYLGGIKYKFCAVVQYSYLFGVTIGYSITTAISLVAMKKAICFHKYGHNHDCTLSNNPFILLFGLIQLLLCQVPNFHKLAFLSYIAALMSFGYASIGLGLSVAKIAEGRHVTTSITGKPIDDHYTAAEKMWSCSAAVGNIAFAYAFAVVLIEIQDTIRS...

XP_057802598.1
MMNVESLNIEAPPGYDTSVVDDDGRPKRTGNVWSAGAHIITAVIGSGVLTLAWAIAQMGWIAGPTALLVFSLITLFTSTLLADCYRAADGTRNYVYRDAVKAYLGGIKYKFCAVVQYSYLFGVTIGYSITTAISLVAMKKAICFHKYGHNHDCTLSNNPFILLFGLIQLLLCQVPNFHKLAFLSYIAALMSFGYASIGLGLSVAKIAEGRHVTTSITGKPIDDHYTAAEKMWSCSAAVGNIAFAYAFAVVLIEIQDTIRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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