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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001411`

染色体: Chr03 坐标: 16775733-16779393 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001411`
名称	SmilChr03G001411
描述	protein trichome birefringence-like 24
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16775733 - 16779393 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017886`
GeneID	`131017886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017886`
原始查询	`LOC131017886`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 24
产物	protein trichome birefringence-like 24
Arabidopsis	`AT4G23790` (TBL24) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 24 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828479] identity=53.3; qcov=0.995; evalue=2.01e-160; confidence=high
Rice	`Os06g0524400` (OsTBL49) - identity=53.5; qcov=0.836; evalue=5.16e-142; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057802604.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802604.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802604.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802604.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802604.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16775920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr3:16775975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,A23,B30
`Chr3:16776002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:16776052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B133
`Chr3:16777790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C53
`Chr3:16777846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B122
`Chr3:16777873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C34
`Chr3:16777929`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B117
`Chr3:16777929`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B117
`Chr3:16777931`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B117
`Chr3:16777931`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B117
`Chr3:16777971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802604.1

426 aa

213

426

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 77-130 aa PF13839 PC-Esterase 131-423 aa

XP_057802605.1

422 aa

211

422

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 73-126 aa PF13839 PC-Esterase 127-419 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802604.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	77	130	8.2e-23	81.2	PMR5 N terminal Domain
`XP_057802604.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	131	423	5.4e-87	293.1	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p
`XP_057802605.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	73	126	8e-23	81.2	PMR5 N terminal Domain
`XP_057802605.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	127	419	5.2e-87	293.1	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946621.1
GCCGCGTCGGTCGATGCAACAACTACAAGAAATACAACTGTGTATATTATATAGAAGAAAAAAAAAAAACAGAGAGATGGTGAGAAAAAAGAATCTTTGAAAACCAATAACTGATCTGGCAGATGCAGTTGTTGAGCTTATGTTATACAAATGGTGAAGAAATTGAAGCATCAATGGTGGAGGTCTCCTCAAAACAACAATTACTCCTTCCTTATCAAATTGGGTGTTTCAGTTCTTCTAGTGGCTCTTGCATTTGTGCT...

XM_057946622.1
GCCGCGTCGGTCGATGCAACAACTACAAGAAATACAACTGTGTATATTATATAGAAGAAAAAAAAAAAACAGAGAGATGGTGAGAAAAAAGAATCTTTGAAAACCAATAACTGATCTGGCAGATGCAGTTGTTGAGCTTATGTTATACAAATGGTGAAGAAATTGAAGCATCAATGGTGGAGGTCTCCTCAAAACAACAATTACTCCTTCCTTATCAAATTGGGTGTTTCAGTTCTTCTAGTGGCTCTTGCATTTGTGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017886
ATGGTGAAGAAATTGAAGCATCAATGGTGGAGGTCTCCTCAAAACAACAATTACTCCTTCCTTATCAAATTGGGTGTTTCAGTTCTTCTAGTGGCTCTTGCATTTGTGCTTATCTACAACAAATCCTCTGATTCTTTTGCACTTTCAGCCTCCCCTTTTCTTCAAAACACCATTTCTCAACAAAATACACATCACATTCCTACCAAAGAGTATGGCACAGACAGTGAAGAAAAGTGCAATCTTTTTACTGGGGAGTGGGT...

LOC131017886
ATGGTGAAGAAATTGAAGCATCAATGGTGGAGGTCTCCTCAAAACAACAATTACTCCTTCCTTATCAAATTGGGTGTTTCAGTTCTTCTAGTGGCTCTTGCATTTGTGCTTATCTACAACAAATCCTCTGATTCTTTTGCACTTTCAGCCTCCCCTTTTCTTCAAAACACCATTTCTCAACAAAATACACATCACATTCCTACCAAAGACAGTGAAGAAAAGTGCAATCTTTTTACTGGGGAGTGGGTTGCTTATAAGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802604.1
MVKKLKHQWWRSPQNNNYSFLIKLGVSVLLVALAFVLIYNKSSDSFALSASPFLQNTISQQNTHHIPTKEYGTDSEEKCNLFTGEWVAYKAEPVYTNRSCSFIEEHQNCMKNGRPDTNYLYWRWSPRGCELPRLDPGRFLQLMRNKSWAFIGDSISRNHVQSFLCLLSEVEEAIEVYHDKNYKSRRWLFPLHNLTVSVIWSPFLVQAAVFEDSNSFSTSDDVELHLDTLDKIWTQPYKSLDYMILSGGKWFLRNAIYYEN...

XP_057802605.1
MVKKLKHQWWRSPQNNNYSFLIKLGVSVLLVALAFVLIYNKSSDSFALSASPFLQNTISQQNTHHIPTKDSEEKCNLFTGEWVAYKAEPVYTNRSCSFIEEHQNCMKNGRPDTNYLYWRWSPRGCELPRLDPGRFLQLMRNKSWAFIGDSISRNHVQSFLCLLSEVEEAIEVYHDKNYKSRRWLFPLHNLTVSVIWSPFLVQAAVFEDSNSFSTSDDVELHLDTLDKIWTQPYKSLDYMILSGGKWFLRNAIYYENNTVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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