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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001424`

染色体: Chr03 坐标: 16858788-16861717 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001424`
名称	SmilChr03G001424
描述	uncharacterized SmilChr03G001424
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16858788 - 16861717 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017897`
GeneID	`131017897`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017897`
原始查询	`LOC131017897`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0214400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0214400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41850` (AT5G41850) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834190] identity=61.3; qcov=0.971; evalue=5.37e-102; confidence=high
Rice	`Os05g0214400` - identity=69.6; qcov=0.833; evalue=9.84e-106; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF01738 (DLH); PF08386 (Abhydrolase_4); PF12695 (Abhydrolase_5); PF12697 (Abhydrolase_6); PF20408 (Abhydrolase_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017897

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802617.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057802617.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802617.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802617.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802617.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16859164`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B17,B21,B9,B90,B92,B99,C26,C75
`Chr3:16860587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C5
`Chr3:16860672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802617.1

245 aa

122

245

Abhydrolase_1

Abhydrolase_11

Abhydrolase_6

Abhydrolase_5

DLH

Abhydrolase_4

PF00561 Abhydrolase_1 43-148 aa PF20408 Abhydrolase_11 43-238 aa PF12697 Abhydrolase_6 45-151 aa PF12695 Abhydrolase_5 103-208 aa PF01738 DLH 114-241 aa PF08386 Abhydrolase_4 138-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802617.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	43	148	6e-12	46.5	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057802617.1`	Pfam	`PF20408`	Abhydrolase_11	Domain	43	238	5.1e-44	151.0	Alpha/beta hydrolase domain
`XP_057802617.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	45	151	2.1e-07	32.5	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057802617.1`	Pfam	`PF12695`	Abhydrolase_5	Domain	103	208	4.3e-09	37.1	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057802617.1`	Pfam	`PF01738`	DLH	Domain	114	241	1.1e-05	25.9	Dienelactone hydrolase family
`XP_057802617.1`	Pfam	`PF08386`	Abhydrolase_4	Family	138	209	9.7e-06	26.4	TAP-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946634.1
ACCCGAGCCCAAGTAGATTTCCCCTTCCCATTCTTTTGGCGCCAACTTGCCTGGTACATATCATAGGGCTTTTCTTTGGAATTCAAATTTAGGATTGGAGAGATGGTGACAAAGCGCGCTTCAAAGAGAAGACGCAAGAACCACAACCTTCCTACTCAACAAGAGGAGCAAGAGCAACCGCCACAAGTAGGAATCGACGCCGATACCAAAAATTCTGCACATGAGTCTCCGGTGGTCGTGCTTGCTCACGGCGCCGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017897
ATGGTGACAAAGCGCGCTTCAAAGAGAAGACGCAAGAACCACAACCTTCCTACTCAACAAGAGGAGCAAGAGCAACCGCCACAAGTAGGAATCGACGCCGATACCAAAAATTCTGCACATGAGTCTCCGGTGGTCGTGCTTGCTCACGGCGCCGGAGCGCCTTCCTCTTCCGATTGGATGCTTAGATGGAAAGTTATGCTGGCCAAGACATTAAATGCCGTTGAAGTAGTGACATTTGACTATCCCTACATTGCTGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802617.1
MVTKRASKRRRKNHNLPTQQEEQEQPPQVGIDADTKNSAHESPVVVLAHGAGAPSSSDWMLRWKVMLAKTLNAVEVVTFDYPYIAGGKRRAPPKAEKLVDFHCDIVRKAMAMYPGHPLVLAGKSMGSRVSCMVAGEKDVSASAVVCLGYPLKGRNGAVRDDTLLQLKVPVMFVQGSKDGLCPLEKLEAVRKKMNSATVLHVIEGGDHSFKISKMHLQSTGSNQEESEQQAVEAIAAFVSQHLKEG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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