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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001425`

染色体: Chr03 坐标: 16898811-16899565 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001425`
名称	SmilChr03G001425
描述	uncharacterized SmilChr03G001425
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16898811 - 16899565 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017898`
GeneID	`131017898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017898`
原始查询	`LOC131017898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsSub52; symbol=OsSub52; hit=Os06g0700000; species=rice; confidence=low
产物	OsSub52; symbol=OsSub52; hit=Os06g0700000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G19170` (SLP3) subtilisin-like serine protease 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816434] identity=41.1; qcov=0.544; evalue=5.26e-06; confidence=low
Rice	`Os06g0700000` (OsSub52) - identity=36.2; qcov=0.67; evalue=4.66e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05922 (Inhibitor_I9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057802618.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802618.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802618.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057802618.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802618.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16899209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C80
`Chr3:16899233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr3:16899444`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B89,C33
`Chr3:16899444`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B89,C33
`Chr3:16899448`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B89,C33
`Chr3:16899448`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B89,C33
`Chr3:16899450`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A6,B126,B33,C35,D1
`Chr3:16899450`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A6,B126,B33,C35,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802618.1

103 aa

103

Inhibitor_I9

PF05922 Inhibitor_I9 71-102 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802618.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	71	102	0.00025	22.4	Peptidase inhibitor I9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946635.1
ATTTTGATATAAAAAGAAAAGAGGAGAGGAGAGAGAGAGCCAGCTGTGAAATAAGCATAAATAGGGGATAGATAGGCAGCACATACATACATACATTTGATAGGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGATGGCTCAAAAAGTGAGCTACATTTCGTTTTCATGAACTACGATCCTGAATATGAGCGCCTGCGATCTATCAAAACGGAGAGAGGGGCGGAAGAGCTTGATTTATACTTGAGTAGGAAACACGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017898
ATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGATGGCTCAAAAAGTGAGCTACATTTCGTTTTCATGAACTACGATCCTGAATATGAGCGCCTGCGATCTATCAAAACGGAGAGAGGGGCGGAAGAGCTTGATTTATACTTGAGTAGGAAACACGACGGAATCTTGGCTAAGAATCTGCAGCCAGGCACCTATAACAAGACCCTCTCATTGGTCATCGTTGATGGCTTCGCCGTTGAATTGACAGAACATCAGGCAAATGTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802618.1
MEMEMEMEMDGSKSELHFVFMNYDPEYERLRSIKTERGAEELDLYLSRKHDGILAKNLQPGTYNKTLSLVIVDGFAVELTEHQANVLRSAKEVRIVEKNQELA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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