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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001428`

染色体: Chr03 坐标: 16911681-16913320 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001428`
名称	SmilChr03G001428
描述	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16911681 - 16913320 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017900`
GeneID	`131017900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017900`
原始查询	`LOC131017900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
产物	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
Arabidopsis	`AT3G03420` (AT3G03420) Ku70-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821258] identity=44.2; qcov=1.23; evalue=2.91e-52; confidence=medium
Rice	`Os04g0482700` - identity=42.5; qcov=1.16; evalue=1.14e-37; confidence=medium
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0031314 (extrinsic component of mitochondrial inner membrane); GO:0033615 (mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly); GO:0034982 (mitochondrial protein processing)
KEGG	-
Pfam	PF09768 (Peptidase_M76)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017900

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057802620.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057802621.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802621.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802621.1`
5	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057802620.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16911812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B67,B97,C5
`Chr3:16912092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:16912111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D3
`Chr3:16912471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr3:16912968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B2,B46,B99,C56
`Chr3:16912977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B48,B74,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802620.1

199 aa

100

199

Peptidase_M76

PF09768 Peptidase_M76 30-196 aa

XP_057802621.1

154 aa

154

Peptidase_M76

PF09768 Peptidase_M76 30-82 aa PF09768 Peptidase_M76 80-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802620.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	30	196	2e-52	178.1	Peptidase M76 family
`XP_057802621.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	30	82	3.4e-29	102.5	Peptidase M76 family
`XP_057802621.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	80	151	3.4e-29	102.5	Peptidase M76 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099917.1
AGAGTGTATTGGGCCCAATGGGCTTTGAGCCCATGCTCATTCTCATAAGCTCTCACCGAATCACGTTGACAGAGATGGGTTCCATTCATGGGAGACGCTAATCTCGGTTCAAAGCCATCACCTGATGCTGGTGGGTCCCCTCCGCCGCCCATCTCCGAAACCATGACGGTGGCGGAATGCGAGGATTTCATCAAGGAAAGTCTCCGAAATCCAACGGTGAGATTTCTAAAGGAGCATTTGGAGAAATCCGGATGCAGCAT...

XR_009099916.1
AGAGTGTATTGGGCCCAATGGGCTTTGAGCCCATGCTCATTCTCATAAGCTCTCACCGAATCACGTTGACAGAGATGGGTTCCATTCATGGGAGACGCTAATCTCGGTTCAAAGCCATCACCTGATGCTGGTGGGTCCCCTCCGCCGCCCATCTCCGAAACCATGACGGTGGCGGAATGCGAGGATTTCATCAAGGAAAGTCTCCGAAATCCAACGGTGAGATTTCTAAAGGAGCATTTGGAGAAATCCGGATGCAGCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017900
ATGGGAGACGCTAATCTCGGTTCAAAGCCATCACCTGATGCTGGTGGGTCCCCTCCGCCGCCCATCTCCGAAACCATGACGGTGGCGGAATGCGAGGATTTCATCAAGGAAAGTCTCCGAAATCCAACGGTGAGATTTCTAAAGGAGCATTTGGAGAAATCCGGATGCAGCATCGGAACTAATTTCGTAAGGGCCGTCAATTGCAAAGAAAGAATTGCTGGTCGATACGTCAGGGGATCTGGGATTGATGTATGCAGCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802620.1
MGDANLGSKPSPDAGGSPPPPISETMTVAECEDFIKESLRNPTVRFLKEHLEKSGCSIGTNFVRAVNCKERIAGRYVRGSGIDVCSNNLEFNDEVQQVIIHELIRAYDDCRANFDCNDCVHLTCSEIRANQLSGDCHYKRELLRGHVKSMKGHGQECVKRRTLQAVAGTPLCSKIAVKDAMEAVWDTCYNDTAPFDRAP

XP_057802621.1
MGDANLGSKPSPDAGGSPPPPISETMTVAECEDFIKESLRNPTVRFLKEHLEKSGCSIGTNFVRAVNCKERIAGRYVRGSGIRANQLSGDCHYKRELLRGHVKSMKGHGQECVKRRTLQAVAGTPLCSKIAVKDAMEAVWDTCYNDTAPFDRAP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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