Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001408`

染色体: Chr01 坐标: 27673850-27676311 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001408`
名称	SmilChr01G001408
描述	uncharacterized SmilChr01G001408
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27673850 - 27676311 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017922`
GeneID	`131017922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017922`
原始查询	`LOC131017922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802647.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057802647.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057802647.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802663.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802647.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27673892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:27673902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B139,C57
`Chr1:27673937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B64,C70
`Chr1:27673945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B135,C57
`Chr1:27673949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:27673979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:27673990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B104,B135,C43,C57
`Chr1:27673990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B135,C43,C57
`Chr1:27674002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:27674029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:27674043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B64,C70
`Chr1:27674058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B64,B85,C70,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946680.1
GGAACAAATCTCTCTCTCTGTCCAACCCTTTTTAAAAAAAAAATTGATGCGCCCCACCCCAGTTCTCTCTCTGCGGAACAAATCTCTCTCTCTCTGCGGAAATTCTCCCTCTCCCTCTCTCGACCGAAGCTTCATTTATTTTCACCGTAAATTGGTCGGCGCCGGAGAAGATGGACCAACCGGATGAGGGTCCTCCTGTTTTGTTGAGACCGGACATAATTAATTCAACGTGGGACGTTGGCACATATTATAAAATAAAG...

XM_057946672.1
GGAACAAATCTCTCTCTCTGTCCAACCCTTTTTAAAAAAAAAATTGATGCGCCCCACCCCAGTTCTCTCTCTGCGGAACAAATCTCTCTCTCTCTGCGGAAATTCTCCCTCTCCCTCTCTCGACCGAAGCTTCATTTATTTTCACCGTAAATTGGTCGGCGCCGGAGAAGATGGACCAACCGGATGAGGGTCCTCCTGTTTTGTTGAGACCGGACATAATTAATTCAACGTGGGACGTTGGCACATATTATAAAATAAAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131017922
ATGGACCAACCGGATGAGGGTCCTCCTGTTTTGTTGAGACCGGACATAATTAATTCAACGTGGGACGTTGGCACATATTATAAAATAAAGTATCTTAGCAAGGAGCAACAAATATTGGAGCTTCAACCAGATGAATTTGAACTGACGACCATGTACTACTTATCTACACTTGGATTTGATTTGGGTCGACCGGGTGAAGAAGATGATAACCAGGAGGAAGAGCCTCATCCATCCGGCTCTTTGAATGATATCCATAGGGC...

LOC131017922
ATGCCCGACTTAGGGCAGGTTGTCGGTAAATGTGTGGCGGAGTTTGCGCACCCCCGATGCTTAAAGTGGAAGTTGCGGAGTCGACCTTCTACAAAGGAGTTACACCCATTCTTCGAGAAAGAGGAGCAACAAATATTGGAGCTTCAACCAGATGAATTTGAACTGACGACCATGTACTACTTATCTACACTTGGATTTGATTTGGGTCGACCGGGTGAAGAAGATGATAACCAGGAGGAAGAGCCTCATCCATCCGGCTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057802647.1
MPDLGQVVGKCVAEFAHPRCLKWKLRSRPSTKELHPFFEKEEQQILELQPDEFELTTMYYLSTLGFDLGRPGEEDDNQEEEPHPSGSLNDIHRARHEETPDLLFDAPIETHEVSALHDTPIGVEDIPWTGTDRRVRGSSSRDGSRGKAREKHGEQANRRVDREYIDNAVRRIDAANEARMQRHSDALHERVKGTLKWFLDEWKGLMSCKSARATDVCSPVPRPTPAPEARPVDDVRDEDAEIRVEDEAICDEDAAGLQVR...

XP_057802655.1
MPDLGQVVGKCVAEFAHPRCLKWKLRSRPSTKELHPFFEKEEQQILELQPDEFELTTMYYLSTLGFDLGRPGEEDDNQEEEPHPSGSLNDIHRARHEETPDLLFDAPIETHEVSALHDTPIGVEDIPWTGTDRRVRGSSSRDGSRGKAREKHGEQANRRVDREYIDNAVRRIDAANEARMQRHSDALHERVKGTLKWFLDEWKGLMSCKSARATDVCSPVPRPTPAPEARPVDDVRDEDAEIRVEDEAICDEDAAGLQVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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