当前解析结果
SmilChr03G001479| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001479 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001479 |
| 描述 | putative cyclic nucleotide-gated ion channel 13 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 17784353 - 17787388 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131017944 |
|---|---|
| GeneID | 131017944 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017944 |
| 原始查询 | LOC131017944 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | putative cyclic nucleotide-gated ion channel 13 |
| 产物 | putative cyclic nucleotide-gated ion channel 13 |
| Arabidopsis | AT5G53130 (CNGC1)cyclic nucleotide gated channel 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835393] identity=65.8; qcov=0.531; evalue=7.71e-22; confidence=medium |
| Rice | Os02g0255000 (OsCNGC2)- identity=56.5; qcov=0.483; evalue=3.65e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017944 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057802680.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057802680.1 |
| 3 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 0.20000 | XP_057802680.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057802680.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802680.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:17785444 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C24,C3 |
Chr3:17785444 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C24,C3 |
Chr3:17785459 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C24,C3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
7 records
下载 cDNA FASTA7 records
下载 CDS FASTA7 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。