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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001415`

染色体: Chr01 坐标: 27744491-27745103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001415`
名称	SmilChr01G001415
描述	basic form of pathogenesis-related protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27744491 - 27745103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017945`
GeneID	`131017945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017945`
原始查询	`LOC131017945`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	basic form of pathogenesis-related protein 1-like
产物	basic form of pathogenesis-related protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G33720` (AT4G33720) CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathosis-related 1 protein) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829514] identity=56.2; qcov=0.976; evalue=3.92e-58; confidence=high
Rice	`Os01g0382400` (OsPR1#012) - identity=54.3; qcov=1; evalue=2.26e-53; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0005615 (GO:0005615)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00188 (CAP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057802691.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057802691.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802691.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802691.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802691.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27744626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C27
`Chr1:27744659`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B136,C27
`Chr1:27744659`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B136,C27
`Chr1:27744665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C35,D11
`Chr1:27744724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr1:27744746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B55
`Chr1:27744758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B9,C3,C43,C46
`Chr1:27744767`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B101
`Chr1:27744767`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B101
`Chr1:27744808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A2,B2,B79,C52
`Chr1:27744824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,D11
`Chr1:27744827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802691.1

164 aa

164

CAP

PF00188 CAP 33-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802691.1`	Pfam	`PF00188`	CAP	Domain	33	149	2.3e-21	77.6	Cysteine-rich secretory protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946708.1
CTCATCTTCCATATATCCAACAAAAATGGAGTCCGCCACCATTTTCCTCCTCATACTTTCCTTCATCGCCGCCGCCGCCTCTGCCGTCGATCCCGCCCGACAGAACTCGCCACAGGACTTCCTGGACGCCCACAACCGCGCACGAGCGGAGGTGGGCGTCCAGCCACTCGCGTGGAGCGCCACCGTGGCCGACTACGCCCTCCGCTACGCCAAGCAGCGCTACGGCGACTGCGAGATGGAGCACTCGATGGGGCCGTACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017945
ATGGAGTCCGCCACCATTTTCCTCCTCATACTTTCCTTCATCGCCGCCGCCGCCTCTGCCGTCGATCCCGCCCGACAGAACTCGCCACAGGACTTCCTGGACGCCCACAACCGCGCACGAGCGGAGGTGGGCGTCCAGCCACTCGCGTGGAGCGCCACCGTGGCCGACTACGCCCTCCGCTACGCCAAGCAGCGCTACGGCGACTGCGAGATGGAGCACTCGATGGGGCCGTACGGCGAGAACCTGGCGGAGGGGTGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802691.1
MESATIFLLILSFIAAAASAVDPARQNSPQDFLDAHNRARAEVGVQPLAWSATVADYALRYAKQRYGDCEMEHSMGPYGENLAEGWGQLSAVDAVGMWVSEKSYYDYASNSCVGDECGHYTQVVWRDSTHVGCARRQCRNGWLFVICCYDPPGNYVGQRPYYKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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