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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001490`

染色体: Chr03 坐标: 17955842-17956975 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001490`
名称	SmilChr03G001490
描述	protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17955842 - 17956975 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017956`
GeneID	`131017956`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017956`
原始查询	`LOC131017956`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1
产物	protein DECREASED SIZE EXCLUSION LIMIT 1
Arabidopsis	`AT4G29860` (EMB2757) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829108] identity=56.1; qcov=1.1; evalue=7.22e-156; confidence=high
Rice	`Os06g0131100` (OsWD40-124) - identity=53.7; qcov=1.04; evalue=9.08e-134; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017956

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802695.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802695.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802695.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802695.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802695.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17955951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:17955964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:17956025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C10,C74
`Chr3:17956045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:17956161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B94,C36,C45
`Chr3:17956245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A5
`Chr3:17956283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr3:17956353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:17956400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr3:17956501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B65
`Chr3:17956626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr3:17956737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802695.1

350 aa

175

350

WD40

PF00400 WD40 9-45 aa PF00400 WD40 282-302 aa PF00400 WD40 309-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802695.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	9	45	1.6e-26	92.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057802695.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	282	302	1.6e-26	92.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057802695.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	309	343	1.6e-26	92.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946712.1
ATGAGCAAGCGGCCTCCTCCTGATCCGGTGGCTGTTCTCCGTGGCCACCGTGCTTCTGTTACGGATGTCTGCTTGCATCCCGTCAAGAACATCCTCTTCAGCGGTTCCACTGATGGGGAATTGCGCATTTGGGACTCATTGCAGCGTAGGACCATTTCATCATCATGGGCTCACAGTGCAGCTCACGGCATCATCAGCATCGCCACTGTTGGGGAGAACAGAGTGATTAGTCAAGGAAGGGATGGAGCTATCAAACTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017956
ATGAGCAAGCGGCCTCCTCCTGATCCGGTGGCTGTTCTCCGTGGCCACCGTGCTTCTGTTACGGATGTCTGCTTGCATCCCGTCAAGAACATCCTCTTCAGCGGTTCCACTGATGGGGAATTGCGCATTTGGGACTCATTGCAGCGTAGGACCATTTCATCATCATGGGCTCACAGTGCAGCTCACGGCATCATCAGCATCGCCACTGTTGGGGAGAACAGAGTGATTAGTCAAGGAAGGGATGGAGCTATCAAACTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802695.1
MSKRPPPDPVAVLRGHRASVTDVCLHPVKNILFSGSTDGELRIWDSLQRRTISSSWAHSAAHGIISIATVGENRVISQGRDGAIKLWDLGEAGSLSRSPLTAIHTNSYHFCKLSLLNKPRVEIMPTEVSGSENSPMKLEARSYVATAGEDLSVVEIWDVNNAEKLVKLPSSSVDRSTKSRGMCMAVGAFSPSESEVYANVVAGFEDGSMVLWDLRNPSLPVTSVKFHSETVLSLSIDNSCGGGVSGSADEKIVTFSLNPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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