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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001498`

染色体: Chr03 坐标: 18313625-18316467 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001498`
名称	SmilChr03G001498
描述	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	18313625 - 18316467 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017964`
GeneID	`131017964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017964`
原始查询	`LOC131017964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
产物	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
Arabidopsis	`AT4G23730` (AT4G23730) Galactose mutarotase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828473] identity=70.3; qcov=0.958; evalue=7.81e-135; confidence=high
Rice	`Os01g0658700` - identity=71; qcov=0.954; evalue=1.02e-129; confidence=high
GO	GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0016853 (isomerase activity); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01263 (Aldose_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802709.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802710.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802709.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802709.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802709.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:18313813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A18,B22,C28
`Chr3:18313920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A18,B22,C28
`Chr3:18313938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A18,B22,C28
`Chr3:18313960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B22,C28
`Chr3:18314525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B124,B18,B61,B85
`Chr3:18314749`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B49,B87
`Chr3:18314749`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B49,B87
`Chr3:18314758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B87,C82,D11
`Chr3:18314914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B22,C28
`Chr3:18315782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802709.1

306 aa

153

306

Aldose_epim

PF01263 Aldose_epim 26-299 aa

XP_057802710.1

260 aa

130

260

Aldose_epim

PF01263 Aldose_epim 26-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802709.1`	Pfam	`PF01263`	Aldose_epim	Family	26	299	4.2e-68	230.7	Aldose 1-epimerase
`XP_057802710.1`	Pfam	`PF01263`	Aldose_epim	Family	26	249	1.3e-49	170.0	Aldose 1-epimerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946726.1
AAGATGTATATGGGCGCTCAATGGTCGCTTCAAAATCTGACCTTTTCCATCTTTTTTATTCAAAATAGGGTGACAAGGTCAAATCAAAACATGGACTAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTCTTGAGACTATATTCTGCTGGCATGTTTATTTTGTGCTGTTGCTTCACAGAACACCCTTTTGATTAACACATTTGTTTTTGTCATTATTAAACTCGTTTCTTGGCCTAATATGCCAAATGCTTCGC...

XM_057946727.1
CTAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTCTTGAGACTATATTCTGCTGGCATGTTTATTTTGTGCTGTTGCTTCACAGAACACCCTTTTGATTAACACATTTGTTTTTGTCATTATTAAACTCGTTTCTTGGCCTAATATGCCAAATGCTTCGCTGTTGGTTCTTGACAAGACTAAAATTATTCGGTTTATTTAAAAGGGTTTAATCATATGTTTAAGAACTGATTATTGGCTGTCCATTTTCATCACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017964
ATGGATCATCATTCTGCAGCAGATGAGAATCAGAGAGCAACAGTTGAAATCAGCAAGGATGAGAATGGGATTTCGCAGGTGCTGCTACGGAGTCCACGTGGCGCATCAGCAAGGGTCAGTCTTCATGGAGGGCAGGTTCGATCATGGAAAACCGAACGGGGCGAAGAACTGCTGTTCACTAGTGCTAAGGCGAATTTGAAGCCGCCGGCAGCTGTGAGAGGAGGAATTCCCATCTGTTTCCCGCAGTTTGGAAAACGTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802709.1
MDHHSAADENQRATVEISKDENGISQVLLRSPRGASARVSLHGGQVRSWKTERGEELLFTSAKANLKPPAAVRGGIPICFPQFGKRGSLEQHGFARNRIWAIDENPPPLQSADSTNKAFIDLFLKSPDDDLKIWPHSFEFRIRVNLSIDGCLSLISRIRNVNCKPFSFSFAYHTYFSVSDISEVRVEGLETLDYLDNLCNRERFTEQGDALTFESEVDRVYLSSRDAVAVFDHERKRTFVMRKEGLPDVVVWNPWEKKAR...

XP_057802710.1
MDHHSAADENQRATVEISKDENGISQVLLRSPRGASARVSLHGGQVRSWKTERGEELLFTSAKANLKPPAAVRGGIPICFPQFGKRGSLEQHGFARNRIWAIDENPPPLQSADSTNKAFIDLFLKSPDDDLKIWPHSFEFRIRVNLSIDGCLSLISRIRNVNCKPFSFSFAYHTYFSVSDISEVRVEGLETLDYLDNLCNRERFTEQGDALTFESEVDRVYLSSRDAVAVFDHERKRTFVMRKEGLPDWFGIRGRRRRER

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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