当前解析结果
SmilChr03G001505| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001505 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001505 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001505 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 18406028 - 18407845 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017971 |
|---|---|
| GeneID | 131017971 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017971 |
| 原始查询 | LOC131017971 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017971 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802716.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057802716.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802716.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802716.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057802716.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:18406053 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B36,C17,C72,D9 |
Chr3:18406110 |
T |
TCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B48,C33 |
Chr3:18406110 |
T |
TCC |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B48,C33 |
Chr3:18406111 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 35 | A1,A18,A22,A24,A3,A7,B139,B17,B35,B36,B38,B5,B55,B56,B59,B61,B62,B69,B9,B91,C14,C16,C17,C22,C23,C28,C32,C43,C60,C65,C68,C76,C8,C84,D6 |
Chr3:18406116 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D10 |
Chr3:18406116 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:18406120 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A1 |
Chr3:18406132 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B36,B72,B90,C17,C8 |
Chr3:18406142 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr3:18406145 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C17 |
Chr3:18406189 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr3:18406191 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B4,B61 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。