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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001424`

染色体: Chr01 坐标: 27874260-27874855 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001424`
名称	SmilChr01G001424
描述	histone H3.2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27874260 - 27874855 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017976`
GeneID	`131017976`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017976`
原始查询	`LOC131017976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H3.2
产物	histone H3.2
Arabidopsis	`AT1G09200` (AT1G09200) Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837440] identity=100; qcov=1; evalue=7.62e-96; confidence=high
Rice	`Os11g0155900` (H3R-11) - identity=100; qcov=1; evalue=5.19e-96; confidence=high
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017976

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802728.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057802728.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057802728.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802728.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802728.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27874423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B109,B122,B66,C24
`Chr1:27874463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:27874473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B55,B74,C74
`Chr1:27874481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:27874484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:27874493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr1:27874494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,C14,C78
`Chr1:27874531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B126
`Chr1:27874592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B11,B66
`Chr1:27874592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B66
`Chr1:27874608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B53,B98,C36
`Chr1:27874612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802728.1

136 aa

136

Histone

PF00125 Histone 44-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802728.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	44	131	7e-39	132.8	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946745.1
CTTCCCACTCATCTCAAATTCCAATCGCCGAAATCCCCATCTTCTTCCCTTCCAAATTCCGAACACAAACCCTAGTAATGGCTCGCACAAAGCAAACCGCCCGCAAATCTACCGGCGGCAAGGCGCCGCGCAAACAGCTGGCAACTAAAGCCGCCAGGAAATCCGCTCCGGCGACTGGCGGAGTGAAGAAACCCCACCGCTTCCGCCCCGGCACCGTCGCTCTACGTGAGATCCGCAAGTATCAGAAATCCACCGAGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017976
ATGGCTCGCACAAAGCAAACCGCCCGCAAATCTACCGGCGGCAAGGCGCCGCGCAAACAGCTGGCAACTAAAGCCGCCAGGAAATCCGCTCCGGCGACTGGCGGAGTGAAGAAACCCCACCGCTTCCGCCCCGGCACCGTCGCTCTACGTGAGATCCGCAAGTATCAGAAATCCACCGAGCTCTTGATCCGGAAGCTCCCGTTCCAGAGGCTTGTTCGCGAGATAGCGCAGGATTTCAAAACTGATCTGAGGTTCCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802728.1
MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRFRPGTVALREIRKYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVAALQEAAEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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