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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001512`

染色体: Chr03 坐标: 18528718-18531760 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001512`
名称	SmilChr03G001512
描述	probable glutathione peroxidase 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	18528718 - 18531760 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017977`
GeneID	`131017977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017977`
原始查询	`LOC131017977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glutathione peroxidase 2
产物	probable glutathione peroxidase 2
Arabidopsis	`AT2G31570` (GPX2) glutathione peroxidase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817715] identity=74.5; qcov=0.821; evalue=7.03e-91; confidence=high
Rice	`Os02g0664000` (OsGpx3) - identity=74.4; qcov=0.796; evalue=5.73e-85; confidence=high
GO	GO:0004602 (glutathione peroxidase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006979 (response to oxidative stress)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00255 (GSHPx); PF00578 (AhpC-TSA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057802726.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.80000	`XP_057802726.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057802726.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802726.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802726.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:18528892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:18529204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D6
`Chr3:18529204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:18529475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr3:18529486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:18529489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C77
`Chr3:18529524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:18529716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C13
`Chr3:18530459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B13
`Chr3:18531448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:18531570`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802726.1

196 aa

196

AhpC-TSA

GSHPx

PF00578 AhpC-TSA 39-102 aa PF00255 GSHPx 39-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802726.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	39	102	4.4e-08	33.8	AhpC/TSA family
`XP_057802726.1`	Pfam	`PF00255`	GSHPx	Family	39	147	2.5e-43	146.8	Glutathione peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946743.1
TCTTGGTGCGAGTGAATAGTAAACATTGTCATAGAATTAACTGTTCAACCACCGAGAACCCAGTAGTTTTATGATGGCGGCCTCCAAAATGGTTGCTTATCATCCACTTTACTTGAGCCTCCTGCTTCAACAAATCAGATTTTCTGTGAATAATTATCCGAAAACTAGAAAAAGGTAGGAGCAGAATAACATGTTTTTGCTAAGACCAATCAACTGGGCATCTATACTCTTCCTCTGCCTTGCGCTATGGTTATATAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017977
ATGTTTTTGCTAAGACCAATCAACTGGGCATCTATACTCTTCCTCTGCCTTGCGCTATGGTTATATAACAGATATCCTACTCTCAAAGATTCAGGAGCAGATTCCCCAAAATCAGTTTACGACTTCACTGTTAAGGATATTCATGGGAATGATGTTCCTTTAAGTAACTACCAGGGGAAGGTTCTTCTGATTGTGAATGTAGCTTCGAAATGTGGTTTAACACAGTCAAATTACAAGGAGTTGAATATTTTGTATGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802726.1
MFLLRPINWASILFLCLALWLYNRYPTLKDSGADSPKSVYDFTVKDIHGNDVPLSNYQGKVLLIVNVASKCGLTQSNYKELNILYERYRDRGFEILAFPCNQFAFQEPGTNEEIEETVCTRFKAEFPIFDKIEVNGKNTTPLYKFLKSEKGGLFVKAIKWNFTKFLVNKEGKVVERYAPATSPLAMEKDIQNILPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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