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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001528`

染色体: Chr03 坐标: 19040345-19042956 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001528`
名称	SmilChr03G001528
描述	putative wall-associated receptor kinase-like 16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	19040345 - 19042956 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017992`
GeneID	`131017992`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017992`
原始查询	`LOC131017992`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative wall-associated receptor kinase-like 16
产物	putative wall-associated receptor kinase-like 16
Arabidopsis	`AT1G21240` (WAK3) wall associated kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838719] identity=44.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os02g0111600` (OsWAK11) - identity=42.2; qcov=0.978; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway); GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07645 (EGF_CA); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017992

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802734.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802734.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802734.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802734.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:19040468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:19040525`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr3:19040525`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr3:19040548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,C60,D11,D7
`Chr3:19040573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B74,B85,C74
`Chr3:19040728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B13,C58
`Chr3:19040743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A8,C78
`Chr3:19040767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:19040777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A8,B29
`Chr3:19040800`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B6,B9,C71,C78
`Chr3:19040800`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B6,B9,C71,C78
`Chr3:19040805`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B108,B85,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802734.1

757 aa

378

757

GUB_WAK_bind

EGF_CA

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF13947 GUB_WAK_bind 40-96 aa PF07645 EGF_CA 299-336 aa PF00069 Pkinase 425-691 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 430-695 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802734.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	40	96	4.3e-08	34.1	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057802734.1`	Pfam	`PF07645`	EGF_CA	Domain	299	336	6.8e-08	33.3	Calcium-binding EGF domain
`XP_057802734.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	425	691	2.3e-45	155.8	Protein kinase domain
`XP_057802734.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	430	695	2.8e-45	155.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946751.1
TGGTAACAAGTGTGCTTTATCGATCAGAATCATGGTGTTTGAGAAACTCAACAACATGCAGGCTTCAATTCTGCTCATCATGTTCATTTTGGCCTCCTCTCCAACACTACTACTCTCATCACAGAATCCCCCCTTAGCTAAGCTCAAGTGCGAAGATCGTTGCGGCGATATACGCATCCCATTCCCTTTCGGCACCACAGAAGAATGCTACATCGACCAGAGTTTTTGGGTCACTTGCAACGACACCGGTTTCAATCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017992
ATGGTGTTTGAGAAACTCAACAACATGCAGGCTTCAATTCTGCTCATCATGTTCATTTTGGCCTCCTCTCCAACACTACTACTCTCATCACAGAATCCCCCCTTAGCTAAGCTCAAGTGCGAAGATCGTTGCGGCGATATACGCATCCCATTCCCTTTCGGCACCACAGAAGAATGCTACATCGACCAGAGTTTTTGGGTCACTTGCAACGACACCGGTTTCAATCCTCCGAAGCTCTTCTGGTGGGACACGTCAGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802734.1
MVFEKLNNMQASILLIMFILASSPTLLLSSQNPPLAKLKCEDRCGDIRIPFPFGTTEECYIDQSFWVTCNDTGFNPPKLFWWDTSVEITDISLDGQIKLQWFIAKNCYYNGKSNISNNPFSWLPKYFTVNNTANKFTIVGCDAYGFVSGRRIERNFTTGCTAMCSSEADLTEGECDGVGCCQTTIPKDVWTVELEVRSYSNYTNVSDFNTCSYAFVVEDASFKFSKANLTNLSRVTKLPLVVDWAIGNGTCEEAKSDATT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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