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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001587`

染色体: Chr03 坐标: 20102180-20105210 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001587`
名称	SmilChr03G001587
描述	beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20102180 - 20105210 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018044`
GeneID	`131018044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018044`
原始查询	`LOC131018044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase 2-like
产物	beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase 2-like
Arabidopsis	`AT5G64570` (XYL4) beta-D-xylosidase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836578] identity=65.6; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0640700` - identity=63.8; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009044 (xylan 1,4-beta-xylosidase activity); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0031222 (arabinan catabolic process); GO:0045493 (xylan catabolic process); GO:0046556 (alpha-L-arabinofuranosidase activity)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00933 (Glyco_hydro_3); PF01915 (Glyco_hydro_3_C); PF14310 (Fn3-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057802765.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057802765.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802765.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802765.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20102917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr3:20102952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:20105014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:20105047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:20105079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802765.1

783 aa

392

783

Glyco_hydro_3

Glyco_hydro_3_C

Fn3-like

PF00933 Glyco_hydro_3 122-363 aa PF01915 Glyco_hydro_3_C 410-639 aa PF14310 Fn3-like 699-766 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802765.1`	Pfam	`PF00933`	Glyco_hydro_3	Domain	122	363	6.2e-35	121.8	Glycosyl hydrolase family 3 N terminal domain
`XP_057802765.1`	Pfam	`PF01915`	Glyco_hydro_3_C	Domain	410	639	1.2e-48	166.4	Glycosyl hydrolase family 3 C-terminal domain
`XP_057802765.1`	Pfam	`PF14310`	Fn3-like	Family	699	766	2.2e-10	41.2	Fibronectin type III-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946782.1
TATTCCCATATCTTAATACAACACAATATCATTTCTTTCATCTCTATAGATTCCACTTGTCAACATCGTCCATTTTCTTTTCCATGTTTTATTCTTTCTTCGCAATGGCCCCTACAAAACACTATGTTTTCCTCTGTTTCACCGCCTTATGCATAATCCTCCTGTTTTTTAGGCCCGTTCTTGCTCATGACCGGCCCGTTTTCGCTTGTGACGTGGAGACCAATCCCGAGCTAAAGAACCTGAGCTTCTGTGACACGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018044
ATGTTTTATTCTTTCTTCGCAATGGCCCCTACAAAACACTATGTTTTCCTCTGTTTCACCGCCTTATGCATAATCCTCCTGTTTTTTAGGCCCGTTCTTGCTCATGACCGGCCCGTTTTCGCTTGTGACGTGGAGACCAATCCCGAGCTAAAGAACCTGAGCTTCTGTGACACGTCATTGGACGTGCAAGCCCGGGTTAGCGATCTCGTGAGCAGGCTAACTCTACACGAGAAAATTGGGTGGCTGGTGCATGGTGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802765.1
MFYSFFAMAPTKHYVFLCFTALCIILLFFRPVLAHDRPVFACDVETNPELKNLSFCDTSLDVQARVSDLVSRLTLHEKIGWLVHGAKGVSRLGIPYYEFWSEALHGISIIGPGSHFTSLVPGATSFPQVILTAATFNETLFETIGKVVSTEARAMYNVRLAGLTFWAPNVNIFRDPRWGRGHETPGEDPVLTSKYATAFVRGLQQRDDGDKDKLKVAACCKQYTAYDVENWKGIQRFTFNALVTQQDFDDTFQPPFKSCV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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