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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001588`

染色体: Chr03 坐标: 20155339-20157347 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001588`
名称	SmilChr03G001588
描述	uncharacterized SmilChr03G001588
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20155339 - 20157347 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018047`
GeneID	`131018047`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018047`
原始查询	`LOC131018047`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=47.6; qcov=0.296; evalue=8.69e-27; confidence=weak
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018047

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802767.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802767.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802767.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802767.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20155906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C53
`Chr3:20155906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:20156064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr3:20156073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A13,A14,A16,A19,A6,B106,B117,B128,B136,B27,B45,B7,B72,B80,B83,B97,C11,C13,C20,C28,C3,C31,C40,C59,C6,C81
`Chr3:20156098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:20156411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B2,B71
`Chr3:20156435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B71
`Chr3:20156464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C71,C86
`Chr3:20156689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,C25,C5,C53
`Chr3:20156704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B71
`Chr3:20156751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B18
`Chr3:20156769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B113,B117,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802767.1

355 aa

178

355

DUF4218

Peptidase_C48

PF13960 DUF4218 7-107 aa PF02902 Peptidase_C48 217-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802767.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	7	107	2e-43	147.6	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057802767.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	217	314	3.7e-11	44.0	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946784.1
ATGTTTTTTTTCAATGTGTTGTGTGGCAAAGTTATAGACGTGTCGAAGTTAGATGATATTCAAAGTCAGATTGTCACGACTTTGTGTATGCTAGAGAAATACTTCCTTCCGTCGTTCTTTGATATCATGGTTCATTTAACTGTCCATCTGGTACGTGAGGTTAAATTATGTGGACCAGTATGGTATAGATGGATGTACCCATTCGAGAGATACATGCGAGTATTAAAGAGTTATGTGAGAAATCGAAATAGACCAGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018047
ATGTTTTTTTTCAATGTGTTGTGTGGCAAAGTTATAGACGTGTCGAAGTTAGATGATATTCAAAGTCAGATTGTCACGACTTTGTGTATGCTAGAGAAATACTTCCTTCCGTCGTTCTTTGATATCATGGTTCATTTAACTGTCCATCTGGTACGTGAGGTTAAATTATGTGGACCAGTATGGTATAGATGGATGTACCCATTCGAGAGATACATGCGAGTATTAAAGAGTTATGTGAGAAATCGAAATAGACCAGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802767.1
MFFFNVLCGKVIDVSKLDDIQSQIVTTLCMLEKYFLPSFFDIMVHLTVHLVREVKLCGPVWYRWMYPFERYMRVLKSYVRNRNRPEGCMAECYIAEEAVEFCSEYLSLRMLYIYGKRSGNSHITIELDDNVFGVKHNLYVDMEDIVPFCELKPISYMCIATYVCFLQSKLNMLPWADMVRFVDPLNIGYIPTTKKDAETANEHMEFRARELSKRLIDTKSNQIFLAPCNVKYHWILTVIDPNKGEIAILDSLYKGIHDKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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