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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001605`

染色体: Chr03 坐标: 20397797-20407179 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001605`
名称	SmilChr03G001605
描述	uncharacterized SmilChr03G001605
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20397797 - 20407179 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018061`
GeneID	`131018061`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018061`
原始查询	`LOC131018061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826729]; symbol=AT4G11270; hit=AT4G11270; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826729]; symbol=AT4G11270; hit=AT4G11270; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G11270` (AT4G11270) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826729] identity=48.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0331300` - identity=40.4; qcov=0.471; evalue=5.02e-154; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018061

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057802773.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802773.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057802773.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802773.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802773.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20397972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B34,B97,C73
`Chr3:20398027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B73,C86
`Chr3:20399390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr3:20399421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B44,B80
`Chr3:20400027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C48
`Chr3:20400361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C59
`Chr3:20400412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D6
`Chr3:20400794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B24
`Chr3:20400943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A24,B46,B50,D3
`Chr3:20401094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D6
`Chr3:20401145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:20401292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802773.1

1472 aa

736

1472

WD40

PF00400 WD40 542-588 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802773.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	542	588	6e-13	49.4	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946790.1
AAAACAAAATAAAACCCGCAAATACATAAACTGCTAAAATACAAGAAACCCAACTTCCGGTTCCAACTCACTCTGAAACTGCTAACTGTGATCCCAAAACCCAAATAGATCCTTCGAGGTCATAACCGGCCGGTCTGGACCGGTCCGCTGATTCTGCAGCCGATGAAGTGTAAATCGGTGGCCTGCATATGGTCGGGCTCACCGCCGGTTCACAGAGTAACCGCCGTCGCCGCACTCCACGAACCGCCGACTCTTTACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018061
ATGAAGTGTAAATCGGTGGCCTGCATATGGTCGGGCTCACCGCCGGTTCACAGAGTAACCGCCGTCGCCGCACTCCACGAACCGCCGACTCTTTACACTGGCGGATCAGATGGCTCCATCATCTGGTGGAACATTAATTCCTCCCTCGCAAAACCGGAAATCAGACCAGTAGCGATGTTGTGTGGTCATGCCGCTCCAATAGCTGATCTAGGGATTTGTTTTCCCCTCGAGCCATCTGAAAATTCAGTTAAATGTGGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802773.1
MKCKSVACIWSGSPPVHRVTAVAALHEPPTLYTGGSDGSIIWWNINSSLAKPEIRPVAMLCGHAAPIADLGICFPLEPSENSVKCGALISAGSDGVLCVWSRESGHCRRRRKLPPWTGSPFMIRTLPLNKRYVCIACTFVNVNQEHPSTVLVEGHESLTDIEVQNSNPLKCTVVIVDSFTLGVVQTVFHGNVCIGPLKSTAVVFTSEDMETQMVMIIDVFGKVLYLPILKDSDLKGPNVPVMSNDSSNLEVMDWADESRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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