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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001625`

染色体: Chr03 坐标: 20875128-20878380 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001625`
名称	SmilChr03G001625
描述	uncharacterized SmilChr03G001625
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20875128 - 20878380 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018075`
GeneID	`131018075`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018075`
原始查询	`LOC131018075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0101800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0101800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G45010` (AT2G45010) PLAC8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819109] identity=61.4; qcov=0.304; evalue=1.83e-33; confidence=low
Rice	`Os03g0101800` - identity=65.5; qcov=0.301; evalue=3.07e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04749 (PLAC8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018075

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057802783.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802783.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802783.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802783.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20875265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B83,C59
`Chr3:20875280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C8,D7
`Chr3:20875314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B106,B11,B124,B15,B26,B90,B92,C10,C21,C39,C48,C71
`Chr3:20876222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C54
`Chr3:20876231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C31
`Chr3:20876272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr3:20876303`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B77
`Chr3:20876303`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B77
`Chr3:20876306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:20876314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,B8,B97,C51,C57
`Chr3:20876360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B3,C10,C7
`Chr3:20878025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B70,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802783.1

289 aa

144

289

PLAC8

PF04749 PLAC8 154-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802783.1`	Pfam	`PF04749`	PLAC8	Family	154	245	1.9e-08	35.8	PLAC8 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946800.1
GTTAGAAATGTCAAATTAGGTTTAGGTGTTTCACACTCTCTCGCGCCGCCGCTCTGCAAATCTCGTGAGTTTGAAATTTCAAACAAAATCTCCGCCGTCCGTCACTGTCGCAGCCACCGTCCGTCGCACCAGCCACTGTCTCACCCACCAGCGCTTCACCCACCGCACCACCTGACGCCTCACCCCCCTCGTCGATCGATTTTGCCGCCCATCTCCGCCTCGGCAAATGGATTAGGCGAAGCCCTTGCCGCCGCCGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018075
GTTAGAAATGTCAAATTAGGTTTAGGTGTTTCACACTCTCTCGCGCCGCCGCTCTGCAAATCTCGTGAGTTTGAAATTTCAAACAAAATCTCCGCCGTCCGTCACTGTCGCAGCCACCGTCCGTCGCACCAGCCACTGTCTCACCCACCAGCGCTTCACCCACCGCACCACCTGACGCCTCACCCCCCTCGTCGATCGATTTTGCCGCCCATCTCCGCCTCGGCAAATGGATTAGGCGAAGCCCTTGCCGCCGCCGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802783.1
VRNVKLGLGVSHSLAPPLCKSREFEISNKISAVRHCRSHRPSHQPLSHPPALHPPHHLTPHPPRRSILPPISASANGLGEALAAAVKSHHREALAAILCCPSPPQRRSQSCRIDFIRRAELQVSPLTYALSGPPKLAFLHSSPTIDRFFSILLHSGLTGLFCPCVLFGRNVTTLNDDIPERSACIGHAVCIEGGIALAIATAACNGIDPDTACLLTEGLLFAWWVCGIYTGMGRQLLQRKYHLKVDLLLESGEYFLSDQT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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