当前解析结果
SmilChr03G001637| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001637 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001637 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001637 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 21114267 - 21117392 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018086 |
|---|---|
| GeneID | 131018086 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018086 |
| 原始查询 | LOC131018086 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018086 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802799.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057802799.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802799.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802799.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057802799.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:21114474 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B122,C86 |
Chr3:21114474 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B122,C86 |
Chr3:21114506 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr3:21114517 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 14 | A15,A21,A3,B100,B11,B117,B119,B131,B24,B31,B41,B89,C21,D10 |
Chr3:21114521 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | B103,B30,B86,C17,C30,C35,C5,C7,C75,C76 |
Chr3:21114534 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B122,B73,C86 |
Chr3:21114538 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr3:21114557 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr3:21114572 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | B124,B131,B36,B49,B79,B80,B83,C55,C59,D8 |
Chr3:21114576 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B140,B33,C82 |
Chr3:21114587 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,C18,C49 |
Chr3:21114607 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B73,B87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。