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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000340`

染色体: Chr03 坐标: 3859136-3867280 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000340`
名称	SmilChr03G000340
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3859136 - 3867280 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018119`
GeneID	`131018119`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018119`
原始查询	`LOC131018119`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.4; qcov=1.04; evalue=2.29e-82; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.1; qcov=0.952; evalue=2.71e-72; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018119

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057802824.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802824.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802824.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802824.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802824.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3859462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B120,C33,C7,D3
`Chr3:3859494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C8
`Chr3:3859527`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B108,C36,C81,C87
`Chr3:3859527`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B108,C36,C81,C87
`Chr3:3859538`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A10,D5
`Chr3:3859538`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A10,D5
`Chr3:3859567`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A19,A20,A4,A7,B112,B119,B120,B136,B22,B32,B61,B63,B64,B83,B88,C22,C24,C39,C40,C57,C59,C72,C74,C78,C79,C85,D7
`Chr3:3859573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D9
`Chr3:3859581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:3859587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,D2
`Chr3:3859591`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A14,C12,C33,C71
`Chr3:3859591`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A14,C12,C33,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802824.1

841 aa

420

841

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 159-319 aa PF23559 WHD_DRP 406-477 aa PF23598 LRR_14 534-713 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802824.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	319	5.3e-37	127.8	NB-ARC domain
`XP_057802824.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	406	477	6.6e-23	81.3	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802824.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	534	713	1.5e-21	77.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946841.1
TCGGTAAAATAATCTTAAAATAATATGGTTGTTGGGATGTCATAATTGTATCTTTTCAATAATACATTGTTAGATAGAATTGAATCATTACCAGTTTCTCTCTTCGATAACTTGTCTCTCTGCAATTGTTATTGTTCCTTCATATGATCTGCAAAATCTTGTAGCAAGAGCATAATTTATTTCTTCTCTTCTCATTCTCTCTCTGCAGTTGTTCCAACATTTTATCTTCGAAATCTTTGTATTAAGAAGATAGTTTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018119
ATGGCTTATTCTACTCTTGTTTCCCTTGAGCGCACCATTGATCAATTCCTCAATCACAATCAATTTTCCATTTCTCATCCTGAAAAAAAACATATTATATCTCTAGATAAATATGTCCTTTCACTCCGAGCTTTTCTTGAGGATTTTCCAGAGAAAGCCAAGAGTTTGGAAGCAAGAATGAGTAATGTAGCAATGGAGGCGGAAGATGTTATTGAATTGTATATGACGGAAAAAATCCACTACAATATTCGATATACCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802824.1
MAYSTLVSLERTIDQFLNHNQFSISHPEKKHIISLDKYVLSLRAFLEDFPEKAKSLEARMSNVAMEAEDVIELYMTEKIHYNIRYTHWVAELRRIKFIFQLRRVRDQMDSIAGEVVQIKNNIIIKDAQLDGYVGASSSSSQGAEAGKTNMVGLNVDLMEIMSRLCGDSRELQILPITGMGGIGKTTLARNAYDHPFSMEHFQIRVWVTISQDYGEQRILSNHLDSLKEFDRERGNISMAVKVYQILVGRRFLIVMDDIWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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