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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000385`

染色体: Chr03 坐标: 4282900-4291525 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000385`
名称	SmilChr03G000385
描述	uncharacterized SmilChr03G000385
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4282900 - 4291525 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018142`
GeneID	`131018142`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018142`
原始查询	`LOC131018142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0539700` - identity=27.9; qcov=0.426; evalue=3.05e-37; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018142

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802844.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057802844.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802844.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802844.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4286507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C58
`Chr3:4286745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr3:4286798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr3:4286880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C28
`Chr3:4287082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:4287231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:4287248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B83
`Chr3:4287249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C15
`Chr3:4287359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C39
`Chr3:4287362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B77,B86
`Chr3:4287367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:4287371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B139,B34,B77,B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802844.1

1153 aa

576

1153

Helitron_like_N

PIF1

PF14214 Helitron_like_N 481-665 aa PF05970 PIF1 1029-1139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802844.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	481	665	1.5e-49	169.5	Helitron helicase-like domain at N-terminus
`XP_057802844.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	1029	1139	1.2e-29	104.2	PIF1-like helicase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946861.1
TTATACCACCTGCCGACCTGCGTTTAGCTTCCTAGCAAAAACAAAGAGATTTCTTGTCAGAATATTTGCCTGTGAAAGTGTGAAATCCGATCTTAGTTCAACAAAAAATCACACTAGACAAATCCATAACACCAACAAAACAAGGAGGGAGGATTGAATCGGTAGATCCATATAAGAAAATCGAGACGAGCCCAGATAACAAGCAAAACGTACTGCAAAAAGAAAAAGGAAAAACAAAGAAGAGAAAAACAGACACATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018142
ATGGCAAAAAGAAGATGTGTGCTTTCAACGGAAGATGGCTCAGACGGCTCTGTGACAACTTCAAGACGTTTATTGTTTAGTTTACCTACTCCATCAGCAACTGATATGGCTACGCCAATTATCTTTGGCCCTGAGTGTTCACATGCTCTAACTACTCAGTCGAGAAGTTTGCGAGATAAGACTTCGAAAAAAAGAAAGAGGCGTGTTCTTATTGTTGACACTGGTGGGAGTGTTCCAATCTCACAAGTGACAGGCTCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802844.1
MAKRRCVLSTEDGSDGSVTTSRRLLFSLPTPSATDMATPIIFGPECSHALTTQSRSLRDKTSKKRKRRVLIVDTGGSVPISQVTGSSSKNGQFFLGPTNVIPRSILSKGCLRRLGSDVTQLPLSNDVNVSWSKRLSKGSCGQRRSKGRTSTSRSAMQKDIEMFRRLIEIPNEAYELPHKDPCQHCKAIRFPNEPPGFCCASGKIKMQLPKMPDELWNLYVNDMTTLGVEFRRRCRTYNNSLAFTSIKMTYDQALAKANKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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