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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000390`

染色体: Chr03 坐标: 4307039-4308805 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000390`
名称	SmilChr03G000390
描述	uncharacterized SmilChr03G000390
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4307039 - 4308805 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018144`
GeneID	`131018144`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018144`
原始查询	`LOC131018144`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0646700; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0646700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0646700` - identity=39.6; qcov=0.172; evalue=5.29e-22; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018144

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802846.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057802846.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802846.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802846.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4307046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C59
`Chr3:4307152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:4307192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B4
`Chr3:4307207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B4
`Chr3:4307235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B4
`Chr3:4307384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B21,B4
`Chr3:4307477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr3:4308066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C85
`Chr3:4308079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:4308149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B85,C35,C58
`Chr3:4308239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C74
`Chr3:4308394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802846.1

588 aa

294

588

Helitron_like_N

PF14214 Helitron_like_N 2-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802846.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	2	135	1.8e-38	133.4	Helitron helicase-like domain at N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946863.1
ATGAGGGCTGAATCGTATCAAGGGATAGTTGAGAGTATAACATCTAATGGTGTTATTAGTGCAAAATCTGTTGGTAAGCGTGTTCTTCTTCCTAAGACCTTTACAAGTGGCCCGCGTGATCTACGTTGTCGTTACATGAATGCGCTGGCACTTGTCGCGAAATTTGGACGCCCAGATATTTTTCTCACAATGACTTGTAATCCAAAGTGGGTGGAAATTCAAAGTGAATTATTTCCTGTTGAGAAGAGTCATAATAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018144
ATGAGGGCTGAATCGTATCAAGGGATAGTTGAGAGTATAACATCTAATGGTGTTATTAGTGCAAAATCTGTTGGTAAGCGTGTTCTTCTTCCTAAGACCTTTACAAGTGGCCCGCGTGATCTACGTTGTCGTTACATGAATGCGCTGGCACTTGTCGCGAAATTTGGACGCCCAGATATTTTTCTCACAATGACTTGTAATCCAAAGTGGGTGGAAATTCAAAGTGAATTATTTCCTGTTGAGAAGAGTCATAATAGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802846.1
MRAESYQGIVESITSNGVISAKSVGKRVLLPKTFTSGPRDLRCRYMNALALVAKFGRPDIFLTMTCNPKWVEIQSELFPVEKSHNRADLYARVFRAKNEELKKEIVKDSLFGVVAAYFYVIEFQKRGLPHVHWLIILQPRYKVTSTDAYDRFVSAEIPDLDLTPHLHSCVINHMMHGPCGELNPKNACMIGEKCKSYYPKEFKLNTEHRLDSYPDYRRRDDGKWLDNRWVVPYNAYLLAKFDCHINVQVCTNVRSVKYLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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