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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000410`

染色体: Chr03 坐标: 4440018-4441370 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000410`
名称	SmilChr03G000410
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4440018 - 4441370 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018155`
GeneID	`131018155`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018155`
原始查询	`LOC131018155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=24.5; qcov=1.04; evalue=7.94e-21; confidence=weak
Rice	`Os12g0500500` - identity=30.7; qcov=0.767; evalue=1.59e-21; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018155

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802855.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802855.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802855.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802855.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4440044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B122,C60
`Chr3:4440049`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A24,A9,B55,C61,D7
`Chr3:4440049`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A24,A9,B55,C61,D7
`Chr3:4440053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B68,B75
`Chr3:4440059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:4440092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B104,B108,B131,B18,C16,C81
`Chr3:4440104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B2,C12
`Chr3:4440108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C45
`Chr3:4440136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B65,C12,C30,C59,C71
`Chr3:4440143`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B131
`Chr3:4440143`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B131
`Chr3:4440159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802855.1

450 aa

225

450

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 4-74 aa PF23598 LRR_14 131-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802855.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	4	74	3.8e-19	69.2	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802855.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	131	330	2.1e-21	76.8	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946872.1
ATGGCAGGCTTCCCTGAAGATTATGAGATCCGTGTCTCAGAACTCATCAAACTCTGGGTAGCTGAGGGCTTTTTGGAAGGTCGAGATGAATCTAAAACGTTGGAAGAGGTGGCGGAAGATGTTTTGGAGGTGCTGGTCGAGCAAAGTCTAGTTTTGGTTACTAGCAAGAAGAGTGATGGCAAAATCAAAAGGTGCAAGCTTCATAGCGTGGTTCGGGATTTTTGTTCAAGACAGGCTGGGGAAGAGAAGTTCCTTCTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018155
ATGGCAGGCTTCCCTGAAGATTATGAGATCCGTGTCTCAGAACTCATCAAACTCTGGGTAGCTGAGGGCTTTTTGGAAGGTCGAGATGAATCTAAAACGTTGGAAGAGGTGGCGGAAGATGTTTTGGAGGTGCTGGTCGAGCAAAGTCTAGTTTTGGTTACTAGCAAGAAGAGTGATGGCAAAATCAAAAGGTGCAAGCTTCATAGCGTGGTTCGGGATTTTTGTTCAAGACAGGCTGGGGAAGAGAAGTTCCTTCTACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802855.1
MAGFPEDYEIRVSELIKLWVAEGFLEGRDESKTLEEVAEDVLEVLVEQSLVLVTSKKSDGKIKRCKLHSVVRDFCSRQAGEEKFLLPIMDYFPNPIVRRHFLPQVLQNHQRVSVGWYDLDLKDSTHSSCTRSIICISQRGYRPKGSIENFKSLKVLHVLRRKDHAFWELGQVFDLIHLTYLASKIPSNIIPSAISKLHNLQTLIIYRSEVSLPDEIWNLEQLRHLIAFSFLPLPDPKDPAKSSLKNFQTLSLATNFVFSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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