当前解析结果
SmilChr03G000425| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000425 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000425 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000425 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 4630017 - 4632066 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018164 |
|---|---|
| GeneID | 131018164 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018164 |
| 原始查询 | LOC131018164 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018164 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057802864.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057802864.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057802864.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057802864.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057802864.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:4630035 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C14,C82 |
Chr3:4630062 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B103,B14,C2 |
Chr3:4630067 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr3:4630079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr3:4630093 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B18,C2,C27,C46,C71 |
Chr3:4630137 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr3:4630149 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B27,B70 |
Chr3:4630164 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,D8 |
Chr3:4630169 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:4630174 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr3:4630176 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B74,C28,C46 |
Chr3:4630177 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。