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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000437`

染色体: Chr03 坐标: 4724393-4725243 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000437`
名称	SmilChr03G000437
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4724393 - 4725243 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018167`
GeneID	`131018167`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018167`
原始查询	`LOC131018167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=24.8; qcov=0.936; evalue=1.34e-08; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018167

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802868.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802868.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802868.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802868.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802868.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4724394`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B95,C54,C71
`Chr3:4724394`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B95,C54,C71
`Chr3:4724433`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B22,B23,C39,D6
`Chr3:4724433`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B22,B23,C39,D6
`Chr3:4724461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B90,B92,D5
`Chr3:4724497`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	78	A1,A15,A18,A21,A23,A24,A5,A6,B102,B112,B118,B127,B128,B130,B139,B140,B15,B18,B19,B24,B3,B30,B31,B37,B40,B41,B44,B49,B5,B53,B54,B56,B57,B59,B60,B62,B63,B66,B69,B7,B70,B75,B77,B80,B82,B84,B85,B86,B87,B88,B94,B95,B96,B97,C1,C16,C18,C28,C3,C34,C37,C39,C45,C47,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C6,C62,C74,C81,C83,C86,C9,D11
`Chr3:4724741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C14
`Chr3:4724774`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B22,B23
`Chr3:4724774`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B22,B23
`Chr3:4724807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B23,C39
`Chr3:4724890`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B21,B56,B59,B65
`Chr3:4724890`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B21,B56,B59,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802868.1

220 aa

110

220

FBA_1

PF07734 FBA_1 26-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802868.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	26	188	2.1e-12	47.4	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946885.1
ATGTGTTCCGCCCTCTTCAGTTGTGGAACCCATCCACTAGAATCTCCAAAAAAACTGCCAGAAATATCTAATGCCAACTTTTTTGATAATTTCGGATTCGGTTGGGTTGAATCGATTGATGAGTACAAGGTGTTTGTGAGTCTGGATGATTATAACTCCAACGTTGGTAAAGTTTATAGTTCAAACACAAAATCATGGAAAACAATTGAGCTCTGCAATGATTTTGTTCTCTGTTGGCAAGGAGGGGCGTTTGCAAGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018167
ATGTGTTCCGCCCTCTTCAGTTGTGGAACCCATCCACTAGAATCTCCAAAAAAACTGCCAGAAATATCTAATGCCAACTTTTTTGATAATTTCGGATTCGGTTGGGTTGAATCGATTGATGAGTACAAGGTGTTTGTGAGTCTGGATGATTATAACTCCAACGTTGGTAAAGTTTATAGTTCAAACACAAAATCATGGAAAACAATTGAGCTCTGCAATGATTTTGTTCTCTGTTGGCAAGGAGGGGCGTTTGCAAGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802868.1
MCSALFSCGTHPLESPKKLPEISNANFFDNFGFGWVESIDEYKVFVSLDDYNSNVGKVYSSNTKSWKTIELCNDFVLCWQGGAFASGKLYWKNAHDEKVIIFLDLKNEVFGRIELPFDPEVYGEIGVLGGFLCVLCFNDERGFRVWVMKESWEKVVTLSHLLELLQPPLVKGLNGDILVNYGSTVVVYDCQDNVFRNLEYCSCCEDTGFSSYEDCVDFLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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